Klíčový rozdíl mezi sigma faktorem a rho faktorem je ten, že sigma faktor je protein potřebný pro zahájení transkripce v bakteriích, zatímco rho faktor je protein potřebný pro ukončení transkripce u bakterií.
Sigma faktor a rho faktor jsou dva důležité faktory pro bakteriální transkripci. Bakteriální transkripce je proces, při kterém je část bakteriální DNA zkopírována do nově vytvořeného řetězce mRNA (messenger RNA). Tento proces je katalyzován enzymem známým jako RNA polymeráza. Bakterie silně spoléhají na transkripci a překlad, aby správně reagovaly na své prostředí. Bakteriální RNA polymeráza se skládá z jádra a struktury holoenzymu. Jádro obsahuje podjednotky β, β′, α a 2ω, zatímco holoenzym obsahuje faktor sigma. Kromě toho je pro bakteriální transkripci velmi důležitý také pomocný faktor k RNA polymeráze známý jako rho faktor.
Co je Sigma Factor?
Sigma faktor nebo faktor specificity je protein potřebný pro zahájení transkripce v bakteriích. Je to bakteriální faktor iniciace transkripce. Tento faktor umožňuje během transkripce vazbu enzymu RNA polymerázy na specifickou oblast DNA nazývanou promotorová oblast. Sigma faktor je normálně homologní s archaálním transkripčním faktorem B a s eukaryotickým transkripčním faktorem TF11B. Kromě toho se specifický sigma faktor daného genu liší v závislosti na genu a signálech prostředí. Promotory jsou vybírány RNA polymerázou v závislosti na sigma faktoru, který je s ní spojen.
Obrázek 01: Faktor Sigma
Faktor sigma lze nalézt také v chloroplastech rostlin jako součást plastidově kódované polymerázy (PEP). Faktor sigma a RNA polymeráza jsou známy jako holoenzym RNA polymerázy. Molekulová hmotnost sigma faktoru se pohybuje kolem 70 kDa. Po zahájení transkripce se sigma faktor z komplexu disociuje. Poté RNA polymeráza pokračuje v prodlužování, dokud transkripce neskončí.
Co je Rho faktor?
Rho faktor je prokaryotický protein zapojený do ukončení transkripce. Rho faktor se obvykle váže na místo pauzy terminátoru transkripce. Toto místo je exponovaná oblast jednořetězcové RNA blízko otevřeného čtecího rámce v sekvencích bohatých na guanin bohatý na cytosin. Je to nezbytný transkripční protein u prokaryot. V Escherichia coli je rho faktor přibližně 274,6 kDa hexamer identických podjednotek. Každá podjednotka má doménu vázající RNA a doménu hydrolýzy ATP. Kromě toho je funkcí rho faktoru aktivita helikázy.
Obrázek 02: Rho faktor
Rho faktor se váže na molekulu RNA a poté využívá svou aktivitu ATPázy k poskytnutí energie k translokaci molekul RNA. Rho faktor provádí translokaci, dokud nedosáhne helikální oblasti RNA-DNA, kde rozvine hybridní (RNA-DNA) duplexní strukturu. Tento proces pozastaví RNA polymerázu v místě terminace a ukončí proces transkripce.
Jaké jsou podobnosti mezi sigma faktorem a Rho faktorem?
- Sigma faktor a rho faktor jsou dva důležité faktory pro bakteriální transkripci.
- Oba jsou přítomny pouze u prokaryot.
- Jsou to bílkoviny složené z aminokyselin.
- Oba jsou proteiny vázající nukleové kyseliny.
- Prokaryota silně spoléhají na tyto faktory při generování mRNA, která může vytvářet zvláštní proteiny a pomáhat jim specificky reagovat na jejich prostředí.
Jaký je rozdíl mezi sigma faktorem a Rho faktorem?
Sigma faktor je protein potřebný pro zahájení transkripce u bakterií, zatímco rho faktor je protein potřebný pro ukončení transkripce u bakterií. Toto je klíčový rozdíl mezi sigma faktorem a rho faktorem. Navíc sigma faktor je protein vázající DNA, zatímco faktor rho je protein vázající RNA.
Níže uvedená infografika představuje rozdíly mezi faktorem sigma a faktorem rho v tabulkové formě pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – Sigma Factor vs Rho Factor
Trankripce je proces, kdy se informace v DNA zkopírují do nové molekuly zvané mRNA (messenger RNA). Tato m-RNA se nakonec podílí na produkci specifického proteinu. Sigma faktor a rho faktor jsou dva důležité faktory pro bakteriální transkripci. Jsou to bílkoviny. Sigma faktor se podílí na iniciaci transkripce u bakterií. Rho faktor je zodpovědný za ukončení transkripce v bakteriích. Toto je shrnutí rozdílu mezi sigma faktorem a rho faktorem.
