Klíčový rozdíl mezi Rho dependentním a Rho nezávislým ukončením je ten, že u Rho dependentního ukončení se Rho faktor váže s transkriptem a ukončuje transkripci přerušením vodíkových vazeb mezi templátem a transkriptem, zatímco Rho nezávislé ukončení ukončuje transkripci vytváří vlásenkovou smyčkovou strukturu a poté v přepisu oblast bohatou na U.
Trankripce je jedním ze dvou stupňů genové exprese. Je to proces, který produkuje sekvenci mRNA z genetické informace skryté v sekvenci DNA genu. Transkripce probíhá ve třech krocích: iniciace, elongace a ukončení. Enzym RNA polymeráza se váže na promotorovou sekvenci genu a začíná katalyzovat syntézu vlákna RNA. Dokud není nalezena terminátorová sekvence, RNA polymeráza přidává nukleotidy a vytváří řetězec RNA. U prokaryot k ukončení dochází prostřednictvím dvou hlavních ukončovacích strategií: Rho závislého ukončení a Rho nezávislého ukončení. Rho faktor je protein, který má helikázovou aktivitu.
Co je ukončení závislé na Rho?
Rho závislá terminace je jedním ze dvou typů transkripční terminační strategie vyskytující se u prokaryot. Rho faktor je protein, který má helikázovou aktivitu.
Obrázek 01: Ukončení závislé na Rho
Rho protein se váže s RNA transkriptem a pohybuje se podél RNA polymerázy ve směru 5'-3', čímž podporuje disociaci vodíkových vazeb mezi templátem DNA a transkriptem RNA. Když faktor Rho dosáhne transkripční bubliny, oddělí hybrid DNA/RNA a uvolní transkript z transkripční bubliny. Když k tomu dojde, přepis ukončí.
Co je nezávislé ukončení Rho?
Nezávislá terminace Rho je druhá strategie, která ukončuje prokaryotickou transkripci. Obvykle má terminátorová oblast invertovanou repetitivní sekvenci. Bezprostředně po invertované repetitivní sekvenci existuje oblast bohatá na adenin (AAAA). Když RNA polymeráza postupuje vpřed, vytváří sekvenci mRNA. Vzhledem k tomu, že tyto dvě oblasti jsou komplementární v oblasti invertované repetitivní sekvence, tvoří strukturu vlásenkové smyčky v důsledku vodíkové vazby. Dalším regionem bude region U bohatých. Struktura vlásenky zastaví aktivitu RNA polymerázy.
Obrázek 02: Nezávislé ukončení Rho
Navíc v oblastech bohatých na U existují slabé interakce mezi U bázemi transkriptu a A bázemi templátu. Tyto slabé vazby adenin-uracil destabilizují templát DNA a transkript RNA a vzájemně se oddělují. Nakonec se přepis uvolní z místa přepisu.
Jaké jsou podobnosti mezi ukončením Rho závislým a nezávislým Rho?
- Rho dependentní a Rho nezávislé ukončení jsou dvě hlavní terminační strategie nalezené u prokaryot.
- Obě formy uvolňují transkript z templátu DNA k ukončení transkripce.
Jaký je rozdíl mezi ukončením závislým na Rho a nezávislým na Rho?
Rho dependentní terminace je zprostředkována Rho proteinem, zatímco Rho nezávislá terminace nastává prostřednictvím vytvoření struktury vlásenkové smyčky. Toto je klíčový rozdíl mezi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením. Kromě toho protein Rho využívá energii ATP, zatímco nezávislé ukončení Rho nezahrnuje protein Rho a nevyužívá energii ATP. Proto je to také významný rozdíl mezi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením.
Níže uvedená infografika ukazuje více srovnání souvisejících s rozdílem mezi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením.
Shrnutí – Rho Dependent vs Rho Independent Ukončení
Rho dependentní a Rho nezávislé terminace jsou dva hlavní transkripční terminační mechanismy vyskytující se u prokaryot. Protein Rho je zodpovědný za terminaci transkripce v terminaci závislé na Rho. Naproti tomu k Rho nezávislému ukončení dochází prostřednictvím vytvoření struktury vlásenkové smyčky. Toto je klíčový rozdíl mezi ukončením závislým na Rho a nezávislým na Rho.
