Klíčový rozdíl mezi inzerčními a náhradními vektory je v tom, že inzerční vektor má schopnost vložit střední délky cizí DNA, zatímco náhradní vektor má schopnost pojmout větší délky cizí DNA.
Fágové vektory jsou bakteriofágy používané pro klonování. Existují dva typy fágových vektorů; jsou to inzerční vektor a náhradní vektor. Také všechny fágové vektory sestávají z neesenciálních genů. Tyto geny však musí být z fágů odstraněny, aby se usnadnily nové inzerty cizí DNA.
Co je to vkládací vektor?
Za prvé, inzerční vektor je nejjednodušší formou lambda klonovacích vektorů. Ve skutečnosti se jedná o typ fágového vektoru, který má jedinečné restrikční místo zavedené do vektorového genomu na pozici případné DNA. Navíc fágová DNA zůstává bez odstranění. Toto neodstranění fágové DNA omezuje velikost inzertů (cizí DNA), které mají být klonovány ve vektoru. Kromě toho jsou tyto vektory užitečné při klonování a expresi cDNA. GT10, GT11 a Zap jsou příklady tohoto vektoru.
Obrázek 01: Lambda Phage
Vektor pro vložení se skládá z jednoho rozpoznávacího místa. Primární funkcí tohoto vektoru je vývoj cDNA knihoven odvozených z eukaryotických mRNA sekvencí. Navíc může pojmout pouze délky cizí DNA v rozmezí 05-11 kb. Má také jedinečné místo štěpení pro vložení cizí DNA.
Co jsou náhradní vektory?
Náhradní vektor nebo substituční vektor je typ fágového vektoru vyvinutého odstraněním střední oblasti „výplňového fragmentu“fágové DNA. Požadovaný inzert cizí DNA nahradí fágovou DNA.
Obrázek 02: Náhradní vektor
Náhradní vektory jsou důležité při vytváření genomických knihoven, jako jsou EMBL4 a Charon40. Tyto vektory mohou pojmout větší délku cizí DNA v rozmezí délek 08-24 kb. Oblast výplně se také skládá z genu, díky kterému je fágový vektor v bakteriálním hostiteli neživotaschopný.
Jaké jsou podobnosti mezi vkládacími a náhradními vektory?
- Vektory pro vkládání a nahrazování jsou fágové vektory.
- Oba vektory obsahují cizí inzerty DNA.
- Oba jsou užitečné při vytváření knihoven DNA.
Jaký je rozdíl mezi vkládacími a náhradními vektory?
Vložení vs náhradní vektory |
|
| Inserční vektor je typ fágového vektoru, který má v genomu fága zavedeno restrikční místo v místě volitelné DNA. | Náhradní vektor je typ fágového vektoru vyvinutý odstraněním střední oblasti „výplňového fragmentu“fágové DNA |
| Velikost vložených fragmentů | |
| 05–11 kb délka | 08–24 kb délka |
| Fragment výplně | |
| Žádný fragment výplně | Fragment výplně bude nahrazen cizí vložkou |
| Funkce | |
| Důležité pro vytvoření cDNA knihoven | Důležité při vytváření genomových knihoven |
| Příklady | |
| GT10, GT11 a Zap jsou příklady | EMBL4 a Charon40 jsou příklady |
| Cleavage Site | |
| Je přítomno jedinečné místo pro štěpení | Místo štěpení obsahuje geny, které nejsou nezbytné pro lytický cyklus |
Shrnutí – vkládání vs. náhradní vektory
Jak inzerční, tak substituční vektory jsou dva typy fágových vektorů. Oba vektory mají restrikční místa, která usnadňují umístění nových cizích DNA inzertů. Inzerční vektory jsou důležité při vytváření knihoven cDNA, zatímco náhradní vektory jsou důležité při vytváření genomových knihoven. Kromě toho inzerční vektory obsahují inzerty DNA se střední délkou. Ale náhradní vektory mohou pojmout větší délky cizích DNA inzertů. Celkově jde o klíčový rozdíl mezi vektory vkládání a nahrazování.
