Klíčový rozdíl mezi 16s a 18s rRNA je ten, že 16s rRNA je součástí podjednotky 30S v prokaryotických ribozomech, zatímco 18s rRNA je součástí podjednotky 40S v eukaryotických ribozomech.
Ribozomální RNA nebo rRNA je strukturální složkou ribozomů. rRNA se účastní mechanismu syntézy proteinů. Ribozomy eukaryot a prokaryot se liší. Eukaryota mají 80s ribozomy, zatímco prokaryota mají 70s ribozomy. Složení rRNA se také mezi těmito dvěma ribozomy liší. Zatímco malé podjednotky eukaryotického ribozomu obsahují 18s rRNA, malé podjednotky prokaryotického ribozomu obsahují 16s rRNA.
Co je 16s rRNA?
16srRNA neboli 16s ribozomální RNA je součástí 30s podjednotky prokaryotického ribozomu. Je tedy součástí malé podjednotky ribozomu. 16s rRNA hraje důležitou roli při stabilizaci translačního mechanismu spolu s ribozomem. 16s rRNA se váže na Shin Dalgarnovu sekvenci prokaryotické mRNA, aby zahájila translaci. Také se váže s 23s rRNA a sestavuje malé a velké podjednotky ribozomu.
Obrázek 01: 16s rRNA
Gen 16s rRNA je přítomen v genomu všech bakterií. Je to dlouhá, specifická a vysoce konzervovaná oblast bakteriálního genomu. Proto je detekce oblasti 16s rRNA u bakterií důležitým krokem ve fylogenetické identifikaci bakterií. V tomto ohledu mohou být navrženy univerzální primery pro amplifikaci oblasti 16s rRNA s následným sekvenováním.
Co je 18s rRNA?
18s rRNA nebo 18s ribozomální RNA je součástí eukaryotické ribozomální podjednotky 40s. Je tedy součástí malé podjednotky eukaryotického ribozomu. 18s rRNA spojená s ribozomem hraje důležitou roli při iniciaci translace u eukaryot.
Obrázek 02: 18s rRNA
Gen kódující 18s rRNA je gen 18s rRNA. Sekvence z tohoto genu je důležitá v molekulární analýze pro rekonstrukci evoluční historie organismů, protože se jedná o vysoce konzervované oblasti. 18s rRNA má vysoké rozlišení pro taxonomické studie u hub, kde se oblast vnitřního transkribovaného spaceru (ITS) 18s rRNA používá hlavně pro studie diverzity hub jako marker čárového kódu plísní. Oblast ITS se většinou používá v metagenomické analýze.
Jaké jsou podobnosti mezi 16s a 18s rRNA?
- 16s a 18s rRNA jsou součástí malé podjednotky ribozomu.
- Jak 16s, tak 18s rRNA se nacházejí v cytoplazmě.
- Oba mají odpovídající geny se specifickou sekvencí.
- Obojí je navíc důležité při zahájení překladu.
- Hrají důležitou roli ve fylogenetické analýze.
- Navíc jsou důležité při předpovídání vývoje druhů.
Jaký je rozdíl mezi 16s a 18s rRNA?
16s RNA se nachází jako součást 30. podjednotky prokaryotického ribozomu. 18s rRNA se nachází jako součást 40s podjednotky eukaryotického ribozomu. Toto je klíčový rozdíl mezi 16s a 18s rRNA. 16s rRNA je přítomna v prokaryotech, zatímco 18s rRNA je přítomná v eukaryotech. Navíc gen, který kóduje 16s rRNA, je důležitý při identifikaci a taxonomii bakteriálních druhů, zatímco gen 18s rRNA je důležitý při identifikaci a klasifikaci hub.
Níže uvedená infografika představuje rozdíly mezi 16s a 18s rRNA v tabulkové formě pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – 16s vs 18s rRNA
Ribozomální RNA nebo rRNA jsou strukturální složky ribozomu a tvoří rozsáhlé sekundární struktury při rozpoznávání konzervovaných částí mRNA a tRNA. 16srRNA je součástí 30. podjednotky prokaryotického ribozomu. 18s rRNA je součástí 40s podjednotky eukaryotického ribozomu. Toto je klíčový rozdíl mezi 16s a 18s rRNA. Oba však tvoří součást malé podjednotky ribozomu. Geny, které kódují 16s i 18s rRNA, hrají důležitou roli ve fylogenetické analýze druhů, protože tyto geny jsou vysoce konzervované.