Klíčový rozdíl – 16s rRNA vs 16s rDNA
Ribozomy jsou biologická místa syntézy bílkovin ve všech živých organismech. Ribozomy obsahují dvě složky; malá podjednotka a velká podjednotka. Prokaryotické organismy a eukaryotické organismy se liší složením ribozomu, které obsahují. Každá podjednotka se skládá z ribozomální RNA a různých proteinů. Tyto dvě podjednotky do sebe zapadají a fungují jako jedna během syntézy proteinů. Prokaryotické ribozomy jsou 70S a skládají se z 30S malé podjednotky a 50S velké podjednotky. Eukaryotické ribozomy jsou 80S a skládají se z 40S malé podjednotky a 60S velké podjednotky. U prokaryot je ribozomální RNA malé podjednotky ribozomů známá jako 16s rRNA. Tato 16s rRNA je transkribována z chromozomální DNA, která je známá jako 16s rDNA. 16s rDNA je gen, který transkripcí produkuje 16s rRNA. Klíčový rozdíl mezi 16s rRNA a 16s rDNA je v tom, že 16s rRNA je transkribovaná jednovláknová ribozomální RNA, která je součástí malé podjednotky prokaryot, zatímco 16s rDNA je dvouvláknová chromozomální DNA nebo gen, který kóduje 16s rRNA.. Gen 16s rRNA je 16s rDNA.
Co je 16s rRNA?
rRNA je součástí ribozomů. 16s rRNA je specifická složka 30S malé podjednotky prokaryotického ribozomu, která se váže se Shine-Dalgarnovou sekvencí. Tato 16s rRNA sekvence vykazuje vysokou variabilitu mezi bakteriálními druhy. Lze jej tedy použít pro bakteriální fylogenezi a taxonomii.
Co je 16s rDNA?
Prokaryota mají 70S ribozomy. Malá podjednotka prokaryotických ribozomů je 30S. Ribozomální RNA (rRNA) malé podjednotky 30S je známá jako 16s rRNA a kóduje ji gen 16s rDNA. Proto je 16s rDNA známá jako 16s rRNA gen. 16s rDNA je chromozomální DNA. Je dvouvláknový a je to gen složený z kódujících a nekódujících oblastí. Když je 16s rDNA gen transkribován, produkuje 16s rRNA sekvenci. 16s rDNA je univerzální DNA sekvence u prokaryot. Nicméně sekvence 16s rDNA mezi prokaryoty se liší. Usnadňuje použití 16s rDNA sekvence při přesné identifikaci bakteriálních druhů a také pro objevování nových bakteriálních druhů.
16s rDNA hraje důležitou roli v bakteriální fylogenezi a taxonomii. Proto se používá jako spolehlivý molekulární marker ve fylogenetických studiích prokaryot, protože je vysoce konzervovaný mezi různými druhy. Nukleotidová sekvence rDNA 16s má devět hypervariabilních oblastí (V1-V9), které poskytují dobrý zdroj pro diferenciaci bakterií a archaea.
Obrázek 01: DNA a RNA
Sekvenování 16s rDNA genu usnadnilo reklasifikaci bakterií na nové druhy nebo rody. Proto se tento gen používá v molekulárních laboratořích jako nejběžnější housekeeping marker pro identifikaci mikrobů. Existuje několik důvodů, proč se 16srDNA stal nejlepším markerem pro identifikaci mikrobů, jako je přítomnost 16srDNA ve všech bakteriích, nezměněná povaha funkce genu 16s rDNA v průběhu času a velká velikost 16s rDNA, která z něj činí dost pro informační účely.
Jaké jsou podobnosti mezi 16s rRNA a 16s rDNA?
- Obě jsou nukleové kyseliny.
- Oba se skládají z nukleotidů.
- Oba souvisí s ribozomální RNA.
Jaký je rozdíl mezi 16s rRNA a 16s rDNA?
16s rRNA vs 16s rDNA |
|
16s rRNA je ribozomální RNA složka malé podjednotky 30s ribozomu prokaryot. | 16s rDNA je chromozomální DNA, která kóduje 16s rRNA sekvenci prokaryot. |
Počet vláken | |
16s rRNA je jednovláknová. | 16s rDNA je dvouvláknová |
Gen nebo sekvence | |
16s rRNA je transkribovaná RNA genu. | 16s rDNA je gen. |
Sekvence kódování | |
16s rRNA má pouze kódující sekvenci. | 16s rDNA má kódující i nekódující řetězce. |
Uracil Base | |
16s rRNA obsahuje ve své nukleotidové sekvenci báze uracilu. | 16s rDNA neobsahuje ve svých nukleotidových sekvencích báze Uracilu. |
Thyminová báze | |
16s rRNA ve své nukleotidové sekvenci neobsahuje thyminové báze. | 16s rDNA obsahuje ve svých nukleotidových sekvencích thyminové báze. |
Syntéza | |
16s rRNA se vyrábí po transkripci genu 16s rDNA. | 16s rDNA je v genomu prokaryot. |
Shrnutí – 16s rRNA vs 16s rDNA
16s rRNA je složka ribozomální RNA malé podjednotky ribozomů prokaryot. Gen 16s rDNA kóduje tuto sekvenci RNA. 16s rRNA je jednovláknová a 16s rDNA je dvouvláknová. Toto je rozdíl mezi 16s rRNA a 16s rDNA.
Stáhněte si PDF 16s rRNA vs 16s rDNA
Můžete si stáhnout PDF verzi tohoto článku a použít ji pro offline účely podle citace. Stáhněte si PDF verzi zde Rozdíl mezi 16s rRNA a 16s rDNA