Klíčový rozdíl mezi maximální šetrností a maximální pravděpodobností závisí na metodě použité při vývoji fylogenetického stromu. Maximální šetrnost se zaměřuje na minimalizaci celkových stavů postavy během konstrukce fylogenetického stromu, zatímco maximální pravděpodobnost je statistický přístup při kreslení fylogenetického stromu v závislosti na pravděpodobnosti mezi genetickými daty.
Fylogeneze je nový přístup ke klasifikaci a nomenklatuře organismů. Fylogeneze se opírá o genetická data a evoluční vztahy. Genetická data jsou výsledkem sekvenování DNA. Ve fylogenezi probíhá klasifikace organismů na základě společného předka. Maximální šetrnost a maximální pravděpodobnost fylogenetického vztahu zvyšují přesnost a spolehlivost fylogenetického stromu.
Co je maximální šetrnost?
V technice maximální šetrnosti dochází k minimalizaci celkových změn stavu postavy během fylogenetické analýzy. Fylogenetika je obor biologie, který se zabývá studiem evolučních vztahů. Fylogenetický strom je strom, který ukazuje evoluční vztahy založené na společném předku. Při kreslení fylogenetického stromu pomocí konceptu maximální šetrnosti je tedy množství paralelní evoluce minimalizováno. Proto maximální šetrnost vygeneruje strom mnohem rychleji než jiné metody. Je to proto, že pouze hlavní rozlišovací znaky jsou brány v úvahu v maximální šetrnosti.
Obrázek 01: Maximální šetrnost
Při kreslení maximálně šetrného stromu je strom vždy nejkratší možný strom s minimálním počtem taxonů. Spolehlivost maximálně šetrného stromu je však velmi vysoká. Statistická konzistence a přesnost fylogenetického vztahu založeného na maximální šetrnosti se budou lišit. Navíc existují složité algoritmy, které analyzují maximální šetrnost fylogenetického vztahu.
Co je maximální pravděpodobnost?
Maximální pravděpodobnost je jednou z nejpoužívanějších statistických metod, která analyzuje fylogenetické vztahy. Metoda bude analyzovat fylogenezi na základě pravděpodobnostního modelu. Dále tato metoda bere v úvahu průměr i rozptyl. Ve fylogenezi se tak na daných genetických datech konkrétního organismu získá maximální pravděpodobnost.
Obrázek 02: Maximální pravděpodobnost
Použití statistické metody s maximální pravděpodobností má výhody i nevýhody. Metoda je velmi vhodná při analýze jednoduchého souboru dat obsahujících genetickou informaci. Když je stupeň rozptylu mezi genetickými údaji nižší, jsou maximální skóre pravděpodobnosti spolehlivé. Výsledky generované maximální pravděpodobností dále potvrzují maximální skóre šetrnosti konkrétního fylogenetického vztahu. Proto analýza maximální věrohodnosti funguje jako potvrzující test.
Ve srovnání s výhodami uvedenými výše je tato metoda pomalým a intenzivním procesem. Navíc při absenci jediné datové sady je chybový výstup vysoký. Proto také ztěžuje reprodukovatelnost výsledků odhadem maximální pravděpodobnosti.
Jaké jsou podobnosti mezi maximální šetrností a maximální pravděpodobností?
- Maximální šetrnost a maximální pravděpodobnost jsou dva přístupy, které hrají důležitou roli ve fylogenezi.
- Obě techniky zobrazují vztah organismu k jeho předkovi na základě dostupných genetických dat.
- Fylogenetické stromy lze interpretovat pomocí maximální šetrnosti i maximální pravděpodobnosti.
- V obou technikách se genetická data spoléhají na sekvenování DNA nebo sekvenování RNA.
- Obě metody jsou důležité při generování fylogenetických stromů.
Jaký je rozdíl mezi maximální šetrností a maximální pravděpodobností?
Jak maximální šetrnost, tak maximální pravděpodobnost jsou dva různé přístupy při interpretaci fylogenetického stromu. Maximální šetrnost věří v analýzu několika charakteristik a minimalizaci změn charakteru od organismu k organismu. Naproti tomu metoda maximální věrohodnosti bere v úvahu průměr i rozptyl a získává maximální věrohodnost na daných genetických datech konkrétního organismu. Toto je klíčový rozdíl mezi maximální šetrností a maximální pravděpodobností.
Kromě toho samotná spolehlivost maximální šetrnosti nestačí k vyvození závěru. Metoda maximální věrohodnosti však funguje jako potvrzující test výsledků maximální šetrnosti. Závěry by tedy měly být činěny s použitím maximální šetrnosti i maximální pravděpodobnosti.
Níže uvedená infografika shrnuje rozdíl mezi maximální šetrností a maximální pravděpodobností.
Shrnutí – maximální šetrnost vs. maximální pravděpodobnost
Fylogeneze hraje důležitou roli při odvozování evolučních vztahů konstrukcí fylogenetických stromů. Maximální šetrnost je technika konstrukce stromu s minimálním počtem změn stavu znaků. Naproti tomu maximální pravděpodobnost fylogenetického stromu závisí na použití maximální podobnosti mezi genetickými daty. Data pro obě analýzy pocházejí z dat sekvence DNA nebo RNA. Spolehlivost a přesnost jsou vysoké, když stavba stromu probíhá pomocí obou technik. Toto shrnuje rozdíl mezi maximální šetrností a maximální pravděpodobností.
