Klíčový rozdíl – minisatelit vs mikrosatelit
Repetitivní DNA jsou nukleotidové sekvence opakující se znovu a znovu v genomu organismů. Repetitivní DNA tvoří významnou část genomové DNA a existují tři hlavní typy nazývané tandemové repetice, koncové repetice a vložené repetice. Tandemová opakování jsou vysoce opakované sekvence, které vedle sebe leží bez přerušení. V genomu obratlovců existují tři hlavní typy tandemových repetic. Jsou to satelitní DNA, mikrosatelitní DNA a minisatelitní DNA. Minisatelit je úsek vysoce opakované DNA, který se skládá ze série opakujících se sekvencí složených z 10 až 100 párů bází. Mikrosatelit je úsek repetitivní DNA, který se skládá z krátkých opakujících se sekvencí složených z 1 až 9 párů bází. Proto je klíčovým rozdílem mezi minisatelitem a mikrosatelitem velikost nebo délka opakující se sekvence.
Co je to minisatelit?
Minisatelitní DNA je úsek DNA, který obsahuje sérii krátkých opakujících se sekvencí DNA o délce 10 až 60 párů bází. Minisatelity jsou také označovány jako variabilní počet tandemových repetic (VNTR). Minisatelity jsou často zaměňovány s mikrosatelity. Vědci však nyní rozlišují minisatelity a mikrosatelity na základě velikosti opakující se sekvence.
Minisatelity lze vidět na více než 1000 místech lidského genomu. Tyto krátké sekvence jsou bohaté na G a C. Počet opakování v daném minisatelitu se mezi jednotlivci značně liší.
První lidský minisatelit identifikovali A. R. Wyman a R. White v roce 1980. Později Alec Jeffreys objevil extrémní polymorfismus počtu kopií minisatelitů mezi organismy. Tyto objevy učinily minisatelity jako ideální markery pro DNA fingerprinting, analýzu vazeb a populační studie. Minisatelity také přispívají k regulaci genové exprese, transkripce, alternativního sestřihu atd.
Co je mikrosatelit?
Mikrosatelit je úsek DNA, který má jednoduché sekvenční repetice dlouhé 1 až 10 párů bází. Mikrosatelity se také nazývají krátké sekvence repetice (SSR) nebo jednoduché tandemové repetice (STR). Existují dva typy mikrosatelitů pojmenované jednoduché mikrosatelity a složené mikrosatelity. Jednoduché mikrosatelity se skládají pouze z jednoho typu opakujících se sekvencí. Kompozitní mikrosatelity se skládají z více než jednoho typu repetic. Mikrosatelity mají nejčastěji poly A/T oblasti. Mikrosatelity jsou kodominantní a hojné v eukaryotických genomech.
Podobně jako minisatelity i mikrosatelity vykazují polymorfismus mezi jednotlivci. Počet opakování pro daný mikrosatelit se u jednotlivců liší. Mikrosatelity lze proto použít i jako genetické markery při snímání DNA. Polymorfismus mikrosatelitů lze snadno identifikovat pomocí PCR a gelové elektroforézy. Okrajová oblast mikrosatelitu je u příbuzných druhů vysoce konzervovaná.
Jaké jsou podobnosti mezi minisatelitem a mikrosatelitem?
- Minisatelity a mikrosatelity jsou nekódující sekvence DNA.
- Obě jsou tandemová opakování.
- Obě se skládají z vysoce opakujících se sekvencí.
- Oba mohou být použity jako výkonné genetické markery pro DNA fingerprinting.
Jaký je rozdíl mezi minisatelitem a mikrosatelitem?
Minisatelit vs mikrosatelit |
|
| Minisatelity jsou tandemové repetice s délkou opakování monomeru 10 až 100 párů bází. | Mikrosatelity jsou krátké tandemové repetice, které se skládají z 1 až 9 párů bází opakujících se sekvencí monomerů. |
| Velikost opakující se sekvence | |
| Minisatelit má opakující se sekvence 10 až 100 párů bází. | Mikrosatelit má krátké sekvence 1 až 9 párů bází. |
| Společné základy | |
| Minisatelity jsou bohaté na báze G a C. | Mikrosatelity jsou bohaté na báze A a T. |
| Jiná jména | |
| Minisatelity jsou také známé jako variabilní počet tandemových opakování (VNTR). | Mikrosatelity jsou také známé jako krátké sekvence repetice (SSR) nebo jednoduché tandemové repetice (STR). |
Shrnutí – Minisatelit vs mikrosatelit
Minisatelit a mikrosatelit jsou dva typy tandemových opakování. Rozlišují se na základě počtu bází v opakující se sekvenci nebo velikosti sekvence. Minisatelit má opakující se sekvenci o délce 10 až 100 párů bází, zatímco mikrosatelit má opakující se sekvenci o délce 1 až 9 párů bází. To je hlavní rozdíl mezi minisatelitem a mikrosatelitem. Počet kopií opakující se sekvence v minisatelitech a mikrosatelitech se mezi jednotlivci značně liší. Minisatelity i mikrosatelity jsou silné DNA markery pro analýzu genetických variací v rámci a mezi populacemi druhů.
Stáhnout PDF verzi Minisatellite vs Microsatellite
Můžete si stáhnout PDF verzi tohoto článku a použít ji pro offline účely podle citací. Stáhněte si PDF verzi zde Rozdíl mezi minisatelitem a mikrosatelitem.
