Klíčový rozdíl mezi CDS a cDNA je v tom, že CDS nebo kódující sekvence je součástí transkriptu, který je ve skutečnosti přeložen do proteinu, zatímco sekvence cDNA je sekvence DNA odvozená z mRNA reverzní transkripcí.
Gen je nukleotidová sekvence, která kóduje protein. Skládá se z různých oblastí, jako je oblast promotoru, místo iniciace transkripce, exony, start kodon, introny a stop kodon. Proto má gen jak kódující, tak nekódující sekvence. Kódující sekvence nebo CDS označuje exony a dva kodony, což jsou start kodon a stop kodon. Je to sekvence, která je ve skutečnosti přeložena do proteinu. Naproti tomu cDNA je sekvence DNA odvozená z mRNA reverzní transkripcí.
Co je CDS?
CDS neboli kódující sekvence je část genu, která je ve skutečnosti přeložena do proteinu. Skládá se z exonů a dvou kodonů jako AUG kodon a stop kodon. Na rozdíl od cDNA neobsahuje CDS dvě nepřeložené oblasti: 5' UTR a 3“UTR. Navíc introny nejsou součástí CDS.
Obrázek 01: Sekvence kódování
Ve srovnání s celým genomem a jedincem tvoří kódující sekvence malý zlomek. Kódující sekvence se skládá z nezbytné nukleotidové sekvence k vytvoření aminokyselinové sekvence proteinu.
Co je cDNA?
cDNA nebo komplementární DNA je sekvence DNA vytvořená ze sekvence mRNA. Je syntetizován procesem zvaným reverzní transkripce. Enzym reverzní transkriptáza katalyzuje syntézu cDNA a sekvence mRNA působí jako templát pro syntézu cDNA. V zásadě lze mRNA eukaryotických buněk extrahovat a purifikovat za účelem vytvoření cDNA. Po konstrukci cDNA z mRNA mohou být klonovány do bakteriální buňky, aby se vytvořily knihovny cDNA. cDNA knihovny jsou důležité pro analýzu kódujících oblastí, genových funkcí a expresi genů atd.
Obrázek 02: cDNA
Na rozdíl od kódující sekvence obsahuje cDNA dvě UTR, což jsou 3' UTR a 5' UTR. Podobně jako kódující sekvence, cDNA neobsahuje introny.
Jaké jsou podobnosti mezi CDS a cDNA?
- CDS a cDNA jsou nukleové kyseliny.
- Jsou vyrobeny z deoxyribonukleotidů.
- CDS i CDNA neobsahují introny, což jsou nekódující oblasti.
- Oba obsahují genetický kód nebo informaci pro produkci proteinu.
Jaký je rozdíl mezi CDS a cDNA?
CDS neboli kódující sekvence je část genu, která je ve skutečnosti přeložena do proteinu. Na druhé straně cDNA sekvence je DNA sekvence odvozená z mRNA reverzní transkripcí. Toto je klíčový rozdíl mezi CDS a cDNA. Kromě toho se CDS skládá z exonů a dvou kodonů, což jsou start kodon a stop kodon. Naproti tomu cDNA se skládá z kompletní sekvence mRNA a dvou UTR.
Navíc syntéza cDNA se provádí uměle z mRNA reverzní transkripcí, zatímco CDS se nacházejí v genomové DNA.
Níže uvedená infografika ukazuje další srovnání, abyste poznali rozdíl mezi CDS a cDNA.
Shrnutí – CDS vs cDNA
Kódující sekvence a cDNA jsou dva typy nukleotidových sekvencí. Kódující sekvence leží v genu, zatímco cDNA je syntetizována uměle. Kódující sekvence má exony a dva kodony, zatímco cDNA má sekvenci mRNA a dvě UTR. CDS i cDNA mají pouze nukleotidové sekvence, které se skutečně překládají do proteinu. Neobsahují introny. Na rozdíl od CDS proces syntézy cDNA vyžaduje enzym reverzní transkriptázy. Také cDNA se může převést na knihovny cDNA. Toto shrnuje rozdíl mezi CDS a cDNA.
