Klíčový rozdíl mezi dATP a ddATP je v tom, že dATP neukončuje syntézu DNA, zatímco ddATP je schopen ukončit syntézu DNA. Je to proto, že ddATP má atom H připojený k 3ʹ poloze pentózového cukru, zatímco dATP má OH skupinu připojenou k 3ʹ poloze.
dNTP jsou stavební kameny DNA. Existují čtyři typy dNTP podle purinové nebo pyrimidinové báze - dATP jedna z nich. Dusíkatou bází dATP je adenosin. ddNTP jsou nukleotidy používané v Sangerově sekvenování. Existují čtyři typy ddNTP. ddATP je ddNTPs.
Co je dATP?
Deoxyadenosintrifosfát je nukleotid, který je stavebním kamenem DNA. Enzym DNA polymeráza využívá dATP jako substrát pro syntézu DNA. dATP má tři složky: molekulu cukru deoxyribózy, adenosin a tři fosfátové skupiny. Jedná se tedy o purinový nukleosidtrifosfát. Chemický vzorec dATP je C10H16N5O12 P3, a jeho molekulová hmotnost je 491,182.
Obrázek 01: dATP
dATP se liší od ATP (adenosintrifosfát) v obsahu cukru. ATP má ribózový cukr. dATP se během transkripce páruje s uracilovým nukleotidem. Kromě účasti na syntéze DNA může dATP fungovat také jako molekula přenášející energii, aby byla zachována životaschopnost buněk. Vysoká hladina dATP v těle je toxická, protože může působit jako nekompetitivní inhibitor enzymu ribonukleotidreduktázy. Může to vést k poškození imunitních funkcí.
Co je ddATP?
Dideoxyadenosin triphoafát neboli ddATP je jedním ze čtyř typů nukleotidů používaných v Sangerově sekvenační metodě. Strukturálně má ddATP také tři složky podobné dATP. Jsou to adeninová báze, deoxyribózový cukr a tři fosfáty.
Obrázek 02: ddATP
Na rozdíl od dATP, ddATP postrádá OH skupinu v poloze 3ʹ pentózového cukru, aby se vytvořila fosfodiesterová vazba se sousedním nukleotidem a pokračovalo se v prodlužování řetězce. Má atom H v poloze 3ʹ. Jakmile je tedy ddATP začleněn, syntéza DNA končí. Je to základní princip Sangerova sekvenování. Proto ddATP funguje jako inhibitor prodlužování řetězce v Sangerově sekvenování. V Sangerově sekvenování se používají čtyři zkumavky a do jedné zkumavky se přidá ddATP.
Jaké jsou podobnosti mezi dATP a ddATP?
- dATP a ddATP jsou nukleotidy.
- Oba se skládají z adeninu, deoxyribózy a tří fosfátů.
- Jsou to organické sloučeniny.
- Jak dATP, tak ddATP se přidávají do zkumavek v Sangerově sekvenování.
Jaký je rozdíl mezi dATP a ddATP?
dATP má OH skupinu v 3ʹ poloze pentózového cukru, zatímco ddATP postrádá OH skupinu v 3ʹ poloze pentózového cukru. Dále je dATP monomer používaný při syntéze DNA, zatímco ddATP se používá k ukončení prodlužování řetězce během Sangerova sekvenování. Toto je klíčový rozdíl mezi dATP a ddATP. Navíc dATP může tvořit fosfodiesterové vazby, zatímco ddATP nemůže tvořit fosfodiesterové vazby.
Níže uvedená infografika ukazuje další rozdíly mezi dATP a ddATP v tabulkové formě pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – dATP vs ddATP
Stručně řečeno, dATP je prekurzorem syntézy DNA, zatímco ddATP je nukleotid používaný k ukončení syntézy DNA v Sangerově sekvenování. Navíc dATP má OH skupinu v poloze 3' pentózového cukru a umožňuje vytvoření fosfodiesterové vazby s dalším nukleotidem. Mezitím ddATP postrádá OH skupinu v poloze 3ʹ; proto není schopen vytvořit fosfodiesterovou vazbu s dalším nukleotidem. Výsledkem je, že sekvence DNA přestane prodlužovat. Toto shrnuje rozdíl mezi dATP a ddATP.
