Klíčový rozdíl mezi DNA a proteinovým microarray je v tom, že DNA microarray je sbírka mikroskopických skvrn DNA připojených k pevnému povrchu jako sklíčko, zatímco protein microarray je uspořádání purifikovaných proteinů na pevném povrchu, jako je sklo snímek.
Microarray je laboratoř na čipovém (LOC) zařízení. Jedná se o miniaturní, multiplexní, paralelní zpracovatelské a detekční zařízení. Je to také dvourozměrné pole na pevném povrchu, jako je podložní sklíčko nebo křemíkový tenkovrstvý článek. Microarray testuje velké množství biologického materiálu pomocí vysoce výkonného screeningu. První mikročip byl protilátkový čip, který představil Tse Wen Chang v roce 1983. První genový čip byl představen v roce 1995 Ronem Davisem a Patem Brownem na Stanfordské univerzitě. Proto jsou DNA a proteinové mikročipy dva typy zařízení microarray.
Co je DNA Microarray?
DNA microarray je sbírka mikroskopických skvrn DNA připojených k pevnému povrchu, jako je sklíčko. Vědci používají DNA microarray k měření exprese velkého počtu genů současně. Používá se také ke genotypování více oblastí genomu. DNA microarray se připravuje pomocí robotických strojů. Tyto stroje uspořádají stovky nebo tisíce genových sekvencí (sond) na jediném mikroskopickém sklíčku.
Obrázek 01: DNA Microarray
V mikročipu DNA obsahuje každý bod DNA pikomoly (10−12 molů) specifické sekvence DNA. Tyto DNA sekvence jsou také známé jako sondy nebo reportéry. Tyto sondy jsou krátkým segmentem DNA genu nebo jiného prvku DNA. Mohou hybridizovat s cDNA nebo CRNA ve vzorku za velmi přísných podmínek. Fluorescenčně značené sekvence vzorku, které se vážou na sondy, generují signály, které závisí na podmínkách hybridizace, jako je teplota. Proto lze tuto metodu použít ke stanovení relativního množství sekvencí nukleové kyseliny ve vzorku. Kromě toho je technika DNA microarray široce používána ve studiích genové exprese, srovnávacích genomických studiích, kontrole kontaminace potravin nebo buněčných kultur patogeny, hodnocení genových mutací, identifikaci kandidátů na léky, analýze genetických vazeb atd.
Co je Protein Microarray?
Protein microarray je uspořádání purifikovaných proteinů na pevném povrchu jako podložní sklíčko. Je to metoda používaná k detekci interakcí a aktivit proteinů. Používá se také k určování funkcí proteinů ve velkém měřítku. Hlavní výhodou proteinového mikročipu je, že lze paralelně sledovat velké množství proteinů. Protein microarray je čip, který se skládá z nosného povrchu, jako je sklíčko, nitrocelulózová membrána, kulička nebo mikrotitrační destička. Na tento pevný povrch jsou navázány záchytné proteiny (protilátky, antigeny). Molekuly sondy obvykle značené fluorescenčním barvivem jsou přidány později do pole. Hybridizace mezi sondou a imobilizovanými proteiny vysílá fluorescenční signál, který lze detekovat laserovým skenerem.
Obrázek 02: Protein Microarray
První proteinové pole je protilátkové mikropole (protilátková matrice), které bylo představeno v roce 1983. Proteinové mikropole jsou rychlé, automatizované, vysoce citlivé a ekonomické. Také spotřebují jen malé množství vzorků a činidel. Kromě toho se proteinové mikročipy široce používají k diagnostice onemocnění, funkční analýze proteinů, charakterizaci protilátek a vývoji léčby.
Jaké jsou podobnosti mezi DNA a proteinovým mikročipem?
- DNA a protein microarray jsou dva typy zařízení microarray.
- Obě zařízení jsou založena na principu hybridizace.
- Obě zařízení využívají sondy.
- Používají také fluorescenční signály pro detekci hybridizace.
- Oba jsou nesmírně nápomocní při diagnostice nemocí v medicíně.
Jaký je rozdíl mezi DNA a Protein Microarray?
DNA microarray je sbírka mikroskopických skvrn DNA připojených k pevnému povrchu, jako je sklíčko. Naproti tomu proteinové mikročipy jsou uspořádáním purifikovaných proteinů na pevném povrchu jako podložní sklíčko. Toto je klíčový rozdíl mezi DNA a proteinovým mikročipem. Dále, v DNA mikročipu jsou vzorek a sonda sekvence DNA. Na druhou stranu v proteinovém mikročipu jsou vzorek a sonda proteiny.
Následující infografika představuje rozdíly mezi DNA a proteinovým mikročipem ve formě tabulky.
Shrnutí – DNA vs Protein Microarray
Microarray je vysoce výkonná a multiplexní laboratoř na čipu. Vyrábí se na principu hybridizace. DNA a protein microarray jsou dva typy microarray zařízení. DNA microarray je sbírka mikroskopických skvrn DNA připojených k pevnému povrchu jako podložní sklíčko. Na druhé straně protein microarray je uspořádání purifikovaných proteinů na pevném povrchu, jako je podložní sklíčko. Toto je shrnutí rozdílu mezi DNA a proteinovým microarray.
