Klíčový rozdíl mezi bezbuněčnou DNA a cirkulující nádorovou DNA je ten, že bezbuněčná DNA jsou různé formy DNA, které volně cirkulují v krvi, zatímco cirkulující nádorová DNA je fragmentovaná DNA odvozená z nádoru, která cirkuluje v krvi.
Bezbuněčná DNA a cirkulující nádorová DNA jsou dva typy cirkulujících nukleových kyselin. Cirkulující nukleové kyseliny objevili Mandel a Metal v roce 1948. Později bylo zjištěno, že množství cirkulujících nukleových kyselin u nemocných pacientů je výrazně vysoké. Tento objev byl poprvé učiněn ve vztahu k pacientům s lupusem. Kromě toho mají cirkulující nukleové kyseliny vyšší prognostickou hodnotu a mohou být použity jako biomarker pro detekci různých onemocnění.
Co je to Cell Free DNA?
DNA bez buněk (Cf DNA) označuje různé formy DNA, jako je cirkulující nádorová DNA, bezbuněčná mitochondriální DNA a bezbuněčná fetální DNA atd., které volně cirkulují v krvi. Zvýšené hladiny bezbuněčné DNA jsou pozorovány u pokročilých onemocnění, jako je rakovina, trauma, sepse, infarkt myokardu, cukrovka, mrtvice, srpkovitá anémie atd. Kromě rakoviny a fetální medicíny je bezbuněčná DNA užitečným biomarkerem pro množství nemocí. Tato DNA může být také použita k detekci odmítnutí transplantovaného štěpu. Používají se také při určování běžného stresu, prenatálním rozlišování pohlaví a při testování otcovství.
Obrázek 01: Cell Free DNA
Bezbuněčná DNA je obvykle dvouvláknová extracelulární molekula DNA. Skládá se z malých fragmentů (50 až 200 bp) a větších fragmentů (21 kb). Kromě toho byl již uznáván jako spolehlivý biomarker pro diagnostiku rakoviny prostaty a prsu. Bezbuněčná DNA převážně cirkuluje v krevním řečišti jako nukleozomy. Nukleozomy jsou jaderné komplexy histonů a DNA. Cf DNA lze kvantifikovat pomocí různých technik, jako je PCR, masivně paralelní sekvenování, ultrafialová spektrometrie, barvení PicoGreen a ELISA. Vzhledem k tomu, že detekce Cf DNA v krevním řečišti je rychlá, snadná, neinvazivní, opakující se metoda, bude v budoucnu potenciálním biomarkerem pro diagnostiku řady onemocnění, jako jsou autoimunitní revmatická onemocnění a nádory.
Co je DNA cirkulujícího nádoru?
Circulující nádorová DNA (Ct DNA) je fragmentovaná DNA odvozená z nádoru, která cirkuluje v krvi. Má nádorový původ. Vzhledem k tomu, že cirkulující nádor může odrážet celý genom nádoru, získal širokou přitažlivost pro své potenciální využití v klinických zařízeních. Tekuté biopsie, které odebírají krev, mohou být použity k testování cirkulujících nádorů.
Obrázek 02: Cirkulující nádorová DNA
Biologické procesy, které se pravděpodobně účastní uvolňování Ct DNA, zahrnují apoptózu a nekrózu z odumírajících buněk nebo aktivní uvolňování z nádorových buněk. Ve zdravých tkáních mohou infiltrující fagocyty vyčistit Ct DNA. Kromě toho lze při analýze cirkulující nádorové DNA použít různé techniky, jako je kapičková digitální PCR, BEAMing, CAPP-Seq (hluboké sekvenování), bezpečné sekvenování a duplexní sekvenování.
Jaké jsou podobnosti mezi bezbuněčnou DNA a cirkulující nádorovou DNA?
- Bezbuněčná DNA a cirkulující nádorová DNA jsou dva typy cirkulujících nukleových kyselin.
- Skládají se z nukleotidů.
- Oba typy lze použít jako potenciální markery k diagnostice různých onemocnění v klinických zařízeních.
- Nacházejí se v krevním řečišti.
- Obě jsou extracelulární formy molekul DNA.
- Oba jsou vyčištěny infiltrací fagocytů.
Jaký je rozdíl mezi bezbuněčnou DNA a cirkulující nádorovou DNA?
Bezbuněčná DNA jsou různé formy DNA, jako je cirkulující nádorová DNA, bezbuněčná mitochondriální DNA a bezbuněčná fetální DNA atd., které volně cirkulují v krvi, zatímco cirkulující nádorová DNA je fragmentovaná DNA odvozená z nádoru která koluje v krvi. Toto je klíčový rozdíl mezi bezbuněčnou DNA a cirkulující nádorovou DNA. Kromě toho bezbuněčná DNA cirkuluje ve fragmentech v rozmezí 50-220 bp, zatímco cirkulující nádorová DNA cirkuluje ve fragmentech v rozmezí 134-144 bp.
Následující infografika představuje rozdíl mezi bezbuněčnou DNA a cirkulující nádorovou DNA ve formě tabulky pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – Bezbuněčná DNA versus DNA cirkulujícího nádoru
Cirulující nukleové kyseliny jsou vrženy do krevního řečiště prostřednictvím regulovaných nebo náhodných mechanismů. Bezbuněčná DNA a cirkulující nádorová DNA jsou dva typy cirkulujících nukleových kyselin. DNA bez buněk jsou různé formy DNA, jako je cirkulující nádorová DNA, bezbuněčná mitochondriální DNA, bezbuněčná fetální DNA, která volně cirkuluje v krvi, zatímco cirkulující nádorová DNA je fragmentovaná DNA odvozená od nádoru, která cirkuluje v krvi. Toto shrnuje rozdíl mezi bezbuněčnou DNA a cirkulující nádorovou DNA.
