Klíčový rozdíl mezi T4 DNA ligázou a E. coli DNA ligázou je ten, že T4 DNA ligáza je enzym, který je izolován z bakteriofága T4, zatímco DNA ligáza E. coli je enzym, který je izolován z bakterie E. coli.
DNA ligáza je specifický typ enzymu, který usnadňuje spojování řetězců DNA dohromady tvorbou fosfodiesterové vazby. Hraje důležitou roli při opravě jednořetězcových zlomů a dvouřetězcových zlomů v DNA živých organismů. Kromě toho se DNA ligáza používá jak při opravě DNA, tak při replikaci DNA. Kromě výše uvedených použití má DNA ligáza také rozsáhlé použití v experimentech molekulární biologie, jako je technologie rekombinantní DNA. T4 DNA ligáza a E. coli DNA ligáza jsou dva typy enzymů DNA ligázy.
Co je T4 DNA ligáza?
T4 ligáza je enzym spojující DNA, který je izolován z bakteriofága T4. Bakteriofág T4 je virus, který infikuje Escherichia coli. Enzym T4 ligáza je nejčastěji používanou DNA ligázou v molekulárně biologickém laboratorním výzkumu. Normálně T4 ligáza katalyzuje spojení dvou kohezivních nebo tupých zakončených řetězců dvouřetězcové DNA mezi 5' fosfátovými a 3' hydroxylovými skupinami sousedních nukleotidů. Může také katalyzovat připojení RNA k řetězci DNA nebo RNA v molekule duplexu. Tento enzym však nebude spojovat jednovláknové nukleové kyseliny. Navíc může také ligovat DNA s tupými konci s mnohem větší účinností než DNA ligáza E. coli.
Obrázek 01: T4 DNA ligáza
Tento enzym vyžaduje ATP jako kofaktor. Některé výzkumné experimenty genetického inženýrství již produkovaly aktivnější enzymy DNA ligázy než T4 DNA ligáza divokého typu. V jednom z přístupů vytvořili molekulu fúzního enzymu spojením T4 DNA ligázy s molekulou p50 nebo NF-kB. Tento nový enzym T4 ligáza byl o 160 % aktivnější při ligacích s tupými konci pro účely klonování než T4 DNA ligáza divokého typu. Kromě toho je optimální teplota pro T4 DNA ligázu, která přesněji katalyzuje ligační reakci, 16 °C.
Co je E Coli DNA ligáza?
E. coli DNA ligáza je enzym, který je izolován z bakterií E. coli. Gen odpovědný za tvorbu DNA ligázy E. coli je gen lig. DNA E. coli, ligáza stejně jako většina prokaryotních DNA ligáz využívají energii získanou NAD (nikotinamid adenindinukleotid) k vytvoření fosfodiesterové vazby.
Obrázek 02: E. Coli DNA ligáza
E. coli DNA ligáza je ligační enzym, který může spojovat fragmenty DNA tím, že katalyzuje tvorbu fosfodiesterových vazeb mezi dvouvláknovými fragmenty DNA obsahujícími 5' fosfátové konce a 3' hydroxylové konce. Navíc neliguje DNA s tupými konci, s výjimkou speciálních podmínek, jako je molekulární shlukování polyethylenglykolem. Také nemůže účinně spojit RNA s DNA. Kromě toho může být aktivita DNA ligázy E. coli zvýšena přítomností DNA polymerázy 1 ve správné koncentraci. Pokud je však koncentrace enzymu DNA polymerázy 1 vyšší, má to nepříznivé účinky na aktivitu DNA ligázy E. coli.
Jaké jsou podobnosti mezi T4 DNA ligázou a E Coli DNA ligázou?
- T4 DNA ligáza a E-coli DNA ligáza jsou dva typy enzymů DNA ligázy.
- Oba jsou proteiny složené z aminokyselin.
- Tyto enzymy katalyzují tvorbu fosfodiesterové vazby mezi 5' fosfátovými a 3' hydroxylovými konci vedle sebe v duplexní DNA.
- Mají rozsáhlé využití v experimentech molekulární biologie, jako je technologie rekombinantní DNA.
Jaký je rozdíl mezi T4 DNA ligázou a E Coli DNA ligázou?
T4 DNA ligáza je enzym, který je izolován z bakteriofága T4, zatímco E. coli DNA ligáza je enzym, který je izolován z bakterií E. coli. Toto je klíčový rozdíl mezi T4 DNA ligázou a E. coli DNA ligázou. Kromě toho je zdrojem energie pro T4 DNA ligázu ATP. Na druhé straně zdrojem energie pro E. coli DNA ligázu je NAD.
Níže uvedená infografika představuje rozdíly mezi T4 DNA ligázou a E coli DNA ligázou v tabulkové formě pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – T4 DNA ligáza vs E Coli DNA ligáza
T4 DNA ligáza a E. coli DNA ligáza jsou dva enzymy, které katalyzují tvorbu fosfodiesterové vazby mezi 5' fosfátovými a 3' hydroxylovými konci vedle sebe v duplexní DNA. T4 ligáza je enzym, který je izolován z bakteriofága T4, zatímco E. coli DNA ligáza je enzym, který je izolován z bakterií E. coli. Toto je klíčový rozdíl mezi T4 DNA ligázou a E coli DNA ligázou.
