Klíčový rozdíl mezi avidinem a streptavidinem je ten, že avidin má vysokou afinitu a specificitu k biotinu, ale srovnatelně nižší afinitu než streptavidin, protože streptavidin-biotin je jedním z nejsilnějších komplexů s nekovalentní vazbou.
Avidin je typ proteinu, který se tvoří ve vejcovodech ptáků, plazů a obojživelníků. Streptavidin je typ proteinu, který se připravuje čištěním bakterie Streptomyces avidinii.
Co je Avidin?
Avidin je typ proteinu, který se tvoří ve vejcovodech ptáků, plazů a obojživelníků. Tento protein je tetramerní protein vázající biotin, který se ukládá v bílcích vajec. Kromě tetramerních forem existují dimerní členy avidinu. Tyto dimerní formy můžeme najít u některých bakterií. Když vezmeme v úvahu kuřecí vaječný bílek, má asi 0,05 % avidinu v poměru k celkovému obsahu bílkovin.
Obrázek 01: Chemická struktura a vzhled molekuly avidinu
V tetramerickém proteinu jsou čtyři identické podjednotky. Proto jej můžeme nazvat homotetramer. Každý tetramer se může vázat s biotinem (také nazývaným vitamín B7). Afinita a specificita této vazby jsou velmi vysoké. Komplex avidin-biotin je jednou z nejsilnějších známých nekovalentních vazeb.
V syrových vejcích najdeme funkční avidin. Při vaření se biotinová afinita k avidinu zničí. Přirozená funkce avidinového vajíčka však zatím není přesně známa. Vědci předpokládají, že tento protein se tvoří ve vejcovodu vajíčka jako inhibitor růstu bakterií. Může se vázat s biotinem (biotin je užitečný pro růst bakterií).
Kromě toho existuje neglykosylovaná forma avidinu dostupná jako komerční produkt. Stále není známo, zda se tato neglykosylovaná forma vyskytuje přirozeně nebo ne. Existuje několik důležitých aplikací tohoto proteinu, včetně výzkumných aplikací, biochemických testů, čisticích médií atd.
Co je Streptavidin?
Streptavidin je typ proteinu, který se připravuje čištěním bakterie Streptomyces avidinii. Je to tetramer. Existují homo-tetramery streptavidinu s mimořádně vysokou afinitou k biotinu. Je známo, že vazba biotinu na streptavidin je jednou z nejsilnějších nekovalentních interakcí v přírodě. Tento protein je užitečný v molekulární biologii a bionanotechnologii díky odolnosti komplexu streptavidin-biotin vůči organickým rozpouštědlům, denaturačním činidlům, proteolytickým enzymům, extrémním teplotám, hodnotám pH a detergentům.
Obrázek 02: Struktura a vzhled molekuly streptavidinu
Existují důležité aplikace streptavidinu, jako je čištění nebo detekce různých biomolekul, čištění a detekce geneticky modifikovaných peptidů, ve Western blottingu, vývoji nanobiotechnologie atd.
Jaký je rozdíl mezi avidinem a streptavidinem?
Avidin je typ proteinu, který se tvoří ve vejcovodech ptáků, plazů a obojživelníků. Streptavidin je typ proteinu, který se připravuje čištěním bakterie Streptomyces avidinii. Klíčový rozdíl mezi avidinem a streptavidinem je v tom, že avidin má vysokou afinitu a specificitu pro biotin, ale srovnatelně menší afinitu než streptavidin, protože streptavidin-biotin je jedním z nejsilnějších komplexů, které mají nekovalentní vazbu.
Níže uvedená infografika představuje rozdíly mezi avidinem a streptavidinem ve formě tabulky pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – Avidin vs Streptavidin
Avidin a streptavidin jsou důležité proteiny. Klíčový rozdíl mezi avidinem a streptavidinem je ten, že avidin má vysokou afinitu a specificitu k biotinu, ale srovnatelně nižší afinitu než streptavidin, protože streptavidin-biotin je jedním z nejsilnějších komplexů s nekovalentní vazbou.