Klíčový rozdíl mezi replikativní transpozicí a vyjmutím a vložením je v tom, že při replikativní transpozici se transposon zkopíruje na nové místo, zatímco při vyjmutí a vložení se transposon přesune na nové místo.
Transponovatelné elementy nebo skákací geny jsou sekvence DNA, které mohou změnit svou pozici v genomu. To se nazývá transpozice. Transpozice někdy může vytvořit nebo zvrátit mutace a změnit genetickou identitu buňky a velikost genomu. Transpozici objevila Barbara McClintock v roce 1983. Transpozice může probíhat dvěma technikami, jako je duplikace a vyjmutí a vložení.
Co je replikativní transpozice?
Replikativní transpozice je typ transpozičního mechanismu, který napomáhá excizi transpozonu z nativního místa na jiné prostřednictvím replikované nebo duplikované techniky. Tento mechanismus poprvé objevil James A Shapiro v roce 1979. V tomto mechanismu je transponovatelný prvek během transpoziční reakce duplikován, takže transponující entita je kopií původního prvku. Navíc v tomto mechanismu tvoří sekvence donorové a receptorové DNA charakteristickou mezilehlou konfiguraci „theta“zvanou Shapiro intermediate (cointegrate). Replikativní transpozice je charakteristický retrotransposon. Tento mechanismus se běžně vyskytuje u transpozonů třídy I.
Obrázek 01: Replikativní transpozice
Dobrý příklad replikativní transpozice lze pozorovat u transpozonu E. coli TN3. Transposon TN3 se může přesunout z původního plazmidu do jiného cílového plazmidu replikovanou nebo duplikovanou technikou. Celá tato událost je zprostředkována dvěma důležitými enzymy nazývanými transposáza a resolváza. Kromě toho lze pozorovat replikativní transpozici jak v transpozonech DNA, tak v retropozonech. Nejlépe prozkoumaným transponovatelným bakteriálním virem je bakteriofág Mu.
Co je vyjmout a vložit transpozice?
Transpozice vyjmout a vložit je typ transpozičního mechanismu, který napomáhá excizi transpozonu z nativního místa na jiné pomocí techniky vyjmout a vložit. Tento mechanismus je také známý jako konzervativní model transpozice. V této nereplikativní transpozici dochází k vyříznutí a integraci transpozonu z jednoho genomového místa do druhého, aniž by za sebou zanechala kopii.
Obrázek 02: Transpozice Vyjmout a vložit
V tomto mechanismu se enzym transposáza nejprve naváže na koncové repetice, které jsou obvykle přítomny na obou koncích transposonů, a poté vytvoří strukturu zvanou synaptický komplex (transposozom). Synaptický komplex odštěpí transposon z jeho původního genomového umístění a integruje jej do nového cílového umístění. Poté transpozázy odcházejí z obou konců transpozonu. Jakmile enzym transposáza opustí transposon, mezery vyplní hostitelský enzym polymeráza. To umožňuje úplné připojení transpozonu k novému genomovému umístění. Tento mechanismus se běžně vyskytuje u transpozonů třídy II. Kromě toho jsou bakteriální transpozony TN5 dobře známým příkladem, který ukazuje konzervativní transpoziční mechanismus nebo mechanismus vyjmutí a vložení.
Jaké jsou podobnosti mezi replikativní transpozicí a vyjmutím a vložením?
- Replikativní transpozice a vyjmutí a vložení jsou dva typy transpozičních mechanismů.
- V obou mechanismech se transponovatelné elementy přesouvají z jednoho genomového umístění do jiného nového genomového umístění.
- Oba mechanismy mohou vytvořit nebo zvrátit mutace a změnit genetickou identitu buňky.
- Bakteriální transpozony vykazují oba mechanismy.
- Jsou to nesmírně důležité události pro evoluci.
Jaký je rozdíl mezi replikativní transpozicí a vyjmutím a vložením?
Replikativní transpozice je typ transpozičního mechanismu, kdy je transposon zkopírován do nového umístění, zatímco vyjmout a vložit transpozice je typ transpozičního mechanismu, kdy se transposon přesune na nové místo. Toto je tedy klíčový rozdíl mezi replikativní transpozicí a vyjmutím a vložením. Replikativní transpozice se navíc běžně vyskytuje v transpozonech třídy I, zatímco k transpozici vyjmout a vložit normálně dochází v transpozonech třídy II.
Níže uvedená infografika představuje rozdíly mezi replikativní transpozicí a transpozicí vyjmutím a vložením v tabulkové formě pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – Replikativní transpozice versus vyjmutí a vložení transpozice
Replikativní transpozice a vyjmutí a vložení jsou dva typy transpozičních mechanismů. Replikativní transpozice je typ transpozičního mechanismu, kde je transposon zkopírován do nového umístění, zatímco vyjmout a vložit transpozice je typ transpozičního mechanismu, kdy se transposon přesune na nové místo. Toto shrnuje rozdíl mezi replikativní transpozicí a vyjmutím a vložením.
