Klíčový rozdíl mezi VNTR a sondou je ten, že VNTR je krátká nukleotidová sekvence vyskytující se jako tandemová repetice v genomu, zatímco sonda je uměle syntetizovaná krátká sekvence DNA nebo RNA, která by mohla být radioaktivně označena.
VNTR znamená tandemové opakování s proměnným číslem. Je to krátká nukleotidová sekvence organizovaná v tandemových repeticích v genomu. VNTR se přirozeně vyskytují v našem genomu. Sonda je uměle syntetizovaná krátká sekvence DNA nebo RNA. Sonda i VNTR jsou nukleové kyseliny nebo krátké nukleotidové sekvence. Mají obrovské využití v různých molekulárně biologických technikách, především ve forenzních studiích. VNTR a sonda sdílejí některé podobnosti i rozdíly. Proto se článek pokouší zdůraznit rozdíl mezi VNTR a probe.
Co je VNTR?
VNTR je krátká nukleotidová sekvence, která v našem genomu existuje jako tandemová repetice. VNTR jsou přítomny v mnoha chromozomech. Kromě toho se VNTR mezi různými jednotlivci liší od délek, protože počet opakování se u VNTR různých lidí liší. V podstatě je to kvůli alelám zděděným od jejich rodičů. Proto používáme VNTR hlavně pro rodičovskou identifikaci (dědění) nebo pro osobní účely. Podobně je možné je využít také v genetice, forenzní, biologickém výzkumu a DNA fingerprintingu. Proto je VNTR důležitým nástrojem v molekulární biologii.
Obrázek 01: VNTR
Při dědění analyzujeme data VNTR pomocí dvou základních principů: dědičného párování a párování identit. Během dědičného párování musí mít jedinec shodující se alelu s alelou každého rodiče. Během párování identity musí být obě alely VNTR přítomny ve specifickém umístění genomu.
Co je to sonda?
V kontextu molekulární biologie je sonda uměle syntetizovaný fragment DNA nebo RNA o délce 100 až 1000 bází. Tyto sondy můžeme radioaktivně označit. Proto je používáme při detekci cílových nukleotidových sekvencí, které jsou komplementární k sekvenci sondy. Když do vzorku přidáme sondy, proběhne hybridizace s komplementárními sekvencemi nebo cílovými sekvencemi a usnadní nám identifikaci cílových sekvencí. Protože sondy nesou radioaktivitu, můžeme je snadno detekovat.
Obrázek 02: Sonda
Ve forenzní vědě běžně používáme sondy v technikách profilování DNA, jako je detekce krátkých oblastí tandemové repetice, polymorfismy délky restrikčních fragmentů a DNA fingerprinting.
Jaké jsou podobnosti mezi VNTR a Probe?
- Nukleové kyseliny jsou stavebními kameny VNTR a Probe.
- Používáme je v procesech genové identifikace.
- Obě jejich délky jsou také variabilní.
- Jsou důležitými nástroji ve forenzních studiích, DNA fingerprintingu, genetice atd.
Jaký je rozdíl mezi VNTR a Probe?
VNTR je oblast genomu organizovaná jako tandemové repetice, zatímco sonda je krátká sekvence DNA nebo RNA uměle syntetizovaná za účelem detekce cílových sekvencí ve vzorku. Toto je klíčový rozdíl mezi VNTR a sondou. Důležitým rozdílem mezi VNTR a sondou je také to, že na rozdíl od VNTR můžeme sondy označit radioaktivně.
VNTR navíc většinou provádějí rodičovskou identifikaci, zatímco sondy pomáhají detekovat cílové nukleotidové sekvence ve vzorcích DNA nebo RNA, které jsou komplementární k sekvenci sondy. Proto je to také významný rozdíl mezi VNTR a sondou.
Následující infografika představuje více informací o rozdílu mezi VNTR a sondou.
Shrnutí – VNTR vs Probe
Obvyklé použití VNTR a sondy je v technikách molekulární analýzy, jako jsou forenzní studie a DNA fingerprinting. Oba se skládají z různých délek. Klíčový rozdíl mezi VNTR a sondou je však v tom, že VNTR je oblast genomu uspořádaná s tandemovými repeticemi, zatímco sonda je fragment DNA nebo RNA, který by mohl být radioaktivně označen. Kromě toho jsou v genomu přítomny VNTR. Sondy jsou však uměle syntetizovány a mohly by být značeny radioaktivně pro detekci cílových nukleotidových sekvencí ve vzorcích DNA nebo RNA, které jsou komplementární k sekvenci v sondě. Toto je shrnutí rozdílu mezi VNTR a probe.
