Klíčový rozdíl mezi oligopeptidem a polypeptidem je ten, že oligopeptidy obsahují málo aminokyselinových zbytků, zatímco polypeptidy obsahují velké množství aminokyselinových zbytků.
Pojmy oligopeptidy a polypeptidy spadají do kategorie proteinů. Peptidy jsou krátké řetězce aminokyselin. Aminokyseliny se navzájem vážou prostřednictvím peptidových vazeb. Proto můžeme tyto peptidy kategorizovat podle počtu aminokyselin přítomných v těchto peptidech. Např. dipeptidy, tripeptidy, tetrapeptidy, oligopeptidy a polypeptidy.
Co je to oligopeptid?
Oligopeptid je řetězec aminokyselin, který obsahuje malý počet aminokyselin na molekulu. Tyto molekuly často nazýváme „peptidy“jako obecný termín. Počet aminokyselinových zbytků přítomných v těchto peptidových molekulách se může pohybovat od dvou do dvaceti aminokyselin. Oligopeptidy mohou také zahrnovat některé malé peptidové formy, jako jsou dipeptidy, tripeptidy atd. Některé běžné příklady přirozeně se vyskytujících oligopeptidů zahrnují mikroviridin, kyanopeptoliny, mikrocystiny atd.
Obrázek 01: Struktura tripeptidu
Tyto oligopeptidy jsou produkovány neribozomálními peptidovými syntázami neboli NRPS. Ale existují výjimky. Například cyklamidy a mikroviridin jsou syntetizovány prostřednictvím ribozomických drah. Proces izolace oligopeptidů zahrnuje obohacení oligopeptidů, purifikaci a identifikaci. Pro proces identifikace můžeme použít gelovou chromatografii, HPLC, HPLC-hmotnostní spektroskopii, iontoměničovou chromatografii atd.
Co je to polypeptid
Polypeptid je řetězec aminokyselinových zbytků, které obsahují velké množství aminokyselin. Protein obsahuje jeden nebo více polypeptidových řetězců. V těchto polypeptidových řetězcích jsou aminokyseliny navzájem spojeny prostřednictvím peptidových vazeb, které jsou typem kovalentních chemických vazeb. Každý polypeptidový řetězec obsahuje dva konce: N-terminální a C-terminální. N-konec je amino-konec, který končí volnou aminoskupinou, zatímco C-konec je karboxy-konec, který končí volnou karboxylovou skupinou. Sekvence aminokyselin přítomných v peptidu je určena kodony v mRNA, které se podílejí na produkci polypeptidu nebo proteinu prostřednictvím translace templátového řetězce.
Podle počtu a uspořádání polypeptidů v proteinu existují čtyři hlavní typy proteinových struktur:
- Primární struktura – Primární struktura proteinu obsahuje jeden polypeptidový řetězec, který má disulfidové můstky mezi některými aminokyselinami ve stejném řetězci, což vytváří složenou strukturu.
- Sekundární struktura – Sekundární struktura proteinu má dvě hlavní formy: strukturu alfa-helixu a strukturu beta-listu.
Obrázek 02: Struktura Alpha Helix
- Terciární struktura – Jedná se o vysoce složenou síťovou strukturu. Tato struktura je velmi důležitá, protože určuje funkci proteinu.
- Kvartérní struktura – Jedná se o vysoce komplexní strukturu dvou nebo tří polypeptidových řetězců, které jsou navzájem spojeny.
Jaký je rozdíl mezi oligopeptidem a polypeptidem?
Oligopeptidy a polypeptidy jsou dvě různé kategorie proteinů. Liší se od sebe v závislosti na počtu aminokyselinových zbytků přítomných v molekulách proteinu. Klíčový rozdíl mezi oligopeptidem a polypeptidem je tedy ten, že oligopeptidy obsahují málo aminokyselinových zbytků, zatímco polypeptidy obsahují velké množství aminokyselinových zbytků.
Níže uvedená infografika shrnuje rozdíl mezi oligopeptidem a polypeptidem.
Shrnutí – Oligopeptid vs. Polypeptid
Oligopeptidy a polypeptidy jsou dvě různé kategorie proteinů. Liší se od sebe v závislosti na počtu aminokyselinových zbytků přítomných v těchto proteinových molekulách. To znamená, že klíčový rozdíl mezi oligopeptidem a polypeptidem je ten, že oligopeptidy obsahují málo aminokyselinových zbytků, zatímco polypeptidy obsahují velké množství aminokyselinových zbytků.
