Klíčový rozdíl mezi PARP1 a PARP2 je v tom, že rostlinná a živočišná PARP1 nesou vazebné motivy DNA Zn-prstu, zatímco rostlinná PARP2 nese N-terminální vazebné motivy SAP DNA.
Poly ADP ribóza polymeráza (PARP) je rodina proteinů, které jsou jadernými enzymy. V rodině PARP existuje 17 různých typů enzymů PARP. PARP1 a PARP2 jsou dva enzymy nezbytné pro normální činnosti opravy DNA.
Co je PARP?
PARP (Poly ADP ribóza polymeráza) je rodina proteinů, které slouží v mnoha buněčných procesech, jako je oprava DNA, genomová stabilita a programovaná buněčná smrt. Katalyzují proces zvaný ADP-ribosylace. ADP-ribosylace označuje přidání jednotek ADP-ribózy z nikotinamidadenindinukleotidu (NAD) k cílovým substrátům za účelem opravy zlomů řetězce DNA.
enzymy PARP jsou proteiny vázající DNA. Jsou aktivovány zářezy přítomnými v molekulách DNA. Jakmile se navážou zlomy DNA, hydrolyzují NAD+ na nikotinamid a podporují polymeraci ADP-ribózy. Proto se jaderné enzymy PARP účastní opravy DNA. Poly-ADP-ribosylace navíc funguje jako posttranslační modifikace, která hraje klíčovou roli při replikaci, transkripční regulaci, udržování telomer a degradaci proteinů. Enzymy PARP se také podílejí na udržování stability genomu, regulaci struktury chromatinu, buněčné proliferaci a apoptóze.
Co je PARP1?
PARP1 je členem rodiny proteinů PARP. Je to první a nejlépe charakterizovaný protein v této rodině. Funguje jako první odezva, která detekuje poškození DNA a poté usnadňuje volbu opravného mechanismu. Navíc PARP1 reguluje opravu poškození jednovláknové DNA.
Obrázek 01: PARP1
Kromě opravy jednořetězcových zlomů DNA reguluje PARP1 progresi a restart replikační vidlice. Kromě toho podporuje alternativní nehomologické spojování konců.
Co je PARP2?
PARP2 je dalším členem rodiny proteinů PARP. Úzce souvisí s enzymem PARP1. Gen PARP2 kóduje protein PARP2 u lidí. PARP2 má katalytickou doménu, ale postrádá N-koncovou DNA vazebnou doménu. Protinádorové léky inhibitory PARP mohou inhibovat PARP2, podobně jako PARP1.
Obrázek 02: PARP2
V rostlinách, zejména v Arabidopsis thaliana, hraje PARP2 významnou roli v ochranných reakcích na poškození DNA a bakteriální patogenezi než PARP1.
Jaké jsou podobnosti mezi PARP1 a PARP2?
- PARP1 a PARP2 jsou dva typy jaderných enzymů.
- Používají NAD+ jako substrát ke katalýze poly ADP ribosylace.
- Oba jsou aktivovány jednořetězcovými zlomy DNA.
- Savčí PARP1 a PARP2 se nacházejí v jádře.
- Jak PARP1, tak PARP2 interagují s chromatinem.
- Opravují poškození DNA.
- Některé inhibitory PARP proti rakovině zaměřené na PARP1 také inhibují PARP2.
Jaký je rozdíl mezi PARP1 a PARP2?
PARP1 je členem rodiny proteinů PARP, která má katalytickou doménu a N-koncovou DNA vazebnou doménu, zatímco PARP2 je členem rodiny PARP, která postrádá N-terminální DNA vazebnou doménu. Klíčový rozdíl mezi PARP1 a PARP2 je v tom, že rostlinná a živočišná PARP1 nesou vazebné motivy DNA Zn-prstu, zatímco rostlinná PARP2 nese N-terminální vazebné motivy SAP DNA.
Následující infografika shrnuje rozdíl mezi PARP1 a PARP2.
Shrnutí – PARP1 vs PARP2
PARP jsou jaderné enzymy, které snímají poškození DNA a opravují je. PARP1 a PARP2 jsou dva z nich, které spolu úzce souvisí. Oba enzymy mají katalytickou doménu. Ale PARP2 postrádá N-terminální DNA vazebnou doménu, která je přítomná v PARP1. Toto je klíčový rozdíl mezi PARP1 a PARP2. Oba typy enzymů používají jako substrát NAD+.
