Klíčový rozdíl mezi LAMP a PCR testem je v tom, že LAMP se provádí při konstantní teplotě (60-650C), aby se vytvořily kopie DNA prostřednictvím amplifikace, zatímco PCR se provádí pomocí série teplotních změn k vytvoření kopií DNA prostřednictvím amplifikace.
LAMP a PCR jsou in-vitro amplifikační techniky používané k produkci tisíců kopií DNA. Množství DNA produkované v LAMP je mnohem vyšší než množství produkované v PCR technikách, jako je RT-PCR. LAMP je novější technika ve srovnání s technikou PCR. Ale je to technicky jednoduché a snadné pro vyškoleného vědce provádět v laboratorních podmínkách. Díky tomu je to potenciálně užitečná technika pro detekci COVID-19. Současným standardním testem na COVID-19 je však RT-PCR. Tyto techniky, i když jsou dobře známé výzkumníkům a lékařům se zkušenostmi s amplifikací DNA, mohou být stále relativně neznámé pro širší komunitu.
Co je test LAMP?
Izotermální amplifikace zprostředkovaná smyčkou (LAMP) pro testy COVID-19 začíná odběrem vzorků z nosu nebo krku pomocí tamponu. Vzorky lze odebírat i jinými metodami, jako je hlen z tvrdého kašle. Podobně jako u techniky PCR, jako je RT-PCR, je virová RNA ve vzorku nejprve převedena na DNA, což umožňuje její kopírování. Reakce LAMP se provádí při konstantní teplotě (60-650C).
Amplifikace virové DNA využívající technologii LAMP a činidla lze detekovat, když se reakční směs zakalí v důsledku produkce „pyrofosfátu hořečnatého“. Tato oblačnost umožňuje vědcům a lékařům snadnou diagnostiku COVID-19. Přesnost výsledků testu lze zlepšit použitím speciálních fluorescenčních barviv nebo barviv měnících barvu v reakční směsi. Tato barviva interagují s virovou DNA a lze měřit intenzitu změny světla nebo barvy, aby se získal počet molekul virové RNA přibližně takový, jaký byl původně ve vzorku.
Co je test PCR?
PCR je velmi běžná vědecká technika, která se již 20–30 let široce používá ve výzkumu a medicíně k detekci DNA. PCR testy se používají přímo k detekci antigenu pomocí detekce virové RNA. Obecně je virová RNA přítomna v těle před detekcí protilátek nebo před získáním příznaků onemocnění. Test PCR tedy může zjistit, zda někdo má nebo nemá virus brzy. V současné době je PCR standardním testem pro detekci COVID-19. Existují různé typy PCR technik, jako je real-time PCR, nested PCR, multiplex PCR, hot start PCR a long-range PCR atd. PCR využívá řadu teplotních změn k produkci kopií DNA prostřednictvím amplifikace.
RT-PCR je speciální verze techniky PCR. Používá se při detekci RNA. Nyní se používá k testování COVID-19. RT-PCR je poměrně citlivá a spolehlivá technika. V RT-PCR, jakmile je vzorek odebrán, chemikálie jsou použity k odstranění nežádoucích proteinů, tuků a dalších molekul, přičemž RNA zanechává za sebou. Enzymy testovací soupravy nejprve převedou RNA na DNA, která pak amplifikuje virovou DNA za účelem detekce viru. Fluorescenční barviva se obvykle používají k navázání na amplifikovanou DNA a produkci světla. Toto může být načteno strojem, aby vytvořil výsledek testu.
Jaké jsou podobnosti mezi LAMP a PCR testem?
- Jsou to techniky zesílení.
- Oba produkují zkopírovanou DNA.
- Jsou to velmi citlivé a spolehlivé techniky než imunitní technika, jako je detekce protilátek.
- Oba se používají pro testování na COVID-19.
Jaký je rozdíl mezi LAMP a PCR testem?
Klíčový rozdíl mezi testy LAMP a PCR je v tom, že v LAMP se amplifikace dosahuje pomocí konstantní teploty (60-650C), zatímco u PCR je cyklování požadované teploty. V současné době je k dispozici několik typů technik LAMP. Ale ty nejdůležitější pro detekci COVID-19 jsou izotermická technika zprostředkovaná reverzní transkripční smyčkou (RT-LAMP) a amplifikace zprostředkovaná transkriptem (TMA). Kromě toho jsou v současné době v klinické praxi dostupné různé typy technik PCR pro diagnostiku onemocnění, jako je real-time PCR, RT-PCR, nested PCR, multiplex PCR, hot-start PCR, long-range PCR atd.
Níže uvedená infografika uvádí rozdíly mezi LAMP a PCR testem v tabulkové formě.
Shrnutí – LAMP vs test PCR
Izotermální amplifikace zprostředkovaná smyčkou je podobný proces jako testy PCR, jako je RT-PCR, ale vytváří více kopií virové DNA při konstantní teplotě. Test polymerázové řetězové reakce je v současnosti nejběžnější a standardní formou testování na světě pro diagnostiku onemocnění, jako je diagnóza COVID-19. Je považován za poměrně spolehlivý. PCR využívá řadu teplotních změn k produkci kopií DNA prostřednictvím amplifikace. Toto shrnuje rozdíl mezi LAMP a PCR testem.
