Klíčový rozdíl mezi izoschizomery a izokaudomery je v tom, že izoschizomery rozpoznávají a štěpí stejné restrikční nebo rozpoznávací místo, zatímco izokaudomery rozpoznávají mírně odlišná restrikční místa a štěpí se na stejném místě.
Restrikční enzymy nebo restrikční endonukleázy jsou typem nukleáz, které štěpí dvouvláknovou DNA. Jsou schopny rozpoznat specifické sekvence zvané restrikční místa, která jsou palindromického původu. Bakterie produkují restrikční enzymy proti cizím patogenům, zejména proti virům. Je to forma obranného mechanismu, který vykazují bakterie. V závislosti na struktuře enzymu a povaze štěpení existují tři typy restrikčních enzymů jako restrikční enzymy typu I, restrikční enzymy typu II a restrikční enzymy typu II. Navíc, v závislosti na biochemické aktivitě a zdroji izolace, existují tři typy restrikčních enzymů jako isoschizomery, neoschizomery a isokaudomery.
Co jsou isoschizomery?
Izoschizomery jsou typem restrikčního enzymu, který pochází z různých zdrojů, ale rozpoznává a štěpí stejné restrikční místo v DNA. Proto mají dva izoschizomery stejné rozpoznávací místo. Štěpí na stejném místě, takže jsou specifické pro stejnou rozpoznávací sekvenci. Například restrikční enzymy Sphl a BbuI jsou dva izoschizomery, které rozpoznávají a štěpí na CGTAC/G.
Obrázek 01: Restrikční enzym
Další pár izoschizomerů je HpaII a MspI. Oba rozpoznávají sekvenci 5′-CCGG-3′ a štěpí DNA. Navíc BspEI a Acc III jsou také isoschizomery, které jsou z druhu Bacillus a Acinetobacter calcoaceticus, v daném pořadí. Izolace izoschizomerů může být provedena z různých bakterií. Protože pocházejí z různých bakterií, jejich omezovací podmínky se mohou navzájem lišit.
Co jsou izokaudomery?
Izokaudomery jsou typem restrikčního enzymu, který rozpoznává mírně odlišné sekvence, ale štěpí se na stejném místě za vzniku stejných konců. Izokaudomery také pocházejí z různých bakterií. Sau3a a BamHI jsou dvojice izokaudomerů. Produkují 5'-GATC-3' lepkavý konec po štěpení stejného místa. Další dvojicí izokaudomerů je NcoI z Nocardia corallina a PagI z Pseudomonas alcaligenes. Tyto dva enzymy se také vážou na různé rozpoznávací sekvence, ale štěpí se na stejném místě a produkují stejné lepivé konce. Proto jsou vyráběné řezné konce vzájemně kompatibilní a mohou být vzájemně spojeny. XhoI, PspXI a SalI jsou také izokaudomery.
Jaké jsou podobnosti mezi izoschizomery a izokaudomery?
- Izoschizomery a isokaudomery jsou dva typy restrikčních enzymů.
- Dva isoschizomery mají stejné místo štěpení, podobně jako dva isokaudomery, které mají stejné místo štěpení.
- Jsou prokaryotického původu.
- Oba mají místo rozpoznání restrikce i místo trávení.
- Vyrábějí konce, které jsou vzájemně kompatibilní.
- Tyto enzymy jsou navíc užitečnými nástroji v technologii rekombinantní DNA.
Jaký je rozdíl mezi izoschizomery a izokaudomery?
Izoschizomery jsou restrikční enzymy, které rozpoznávají stejnou sekvenci DNA a štěpí se na stejném restrikčním místě, zatímco isokaudomery jsou restrikční enzymy, které rozpoznávají mírně odlišné sekvence DNA, ale produkují stejné lepivé konce řezáním na stejném místě. Toto je klíčový rozdíl mezi izoschizomery a izokaudomery.
Níže uvedená infografika uvádí rozdíl mezi izoschizomery a izokaudomery.
Shrnutí – izoschizomery vs izokaudomery
Izoschizomery jsou restrikční enzymy, které rozpoznávají stejnou sekvenci DNA a štěpí se na stejném místě. Na druhé straně jsou isokaudomery restrikční enzymy, které rozpoznávají mírně odlišné sekvence a štěpí se na stejném místě za vzniku stejných konců. Toto je klíčový rozdíl mezi izoschizomery a izokaudomery. Sphl, Bbul, HpaII a MspI je několik příkladů isoschizomerů, zatímco Sau3a a BamHI jsou dva příklady isokaudomerů. Jak isoschizomery, tak isokaudomery jsou přirozeně produkovány bakteriemi.
