siRNA vs miRNA
RNA jsou velmi důležité molekuly, které pomáhají budovat život organismů. Nedávno vědci objevili malé RNA nazývané interference RNA nebo RNAi, které po transkripci působí na kontrolu genové exprese. Dva hlavní typy malých RNA jsou mikro RNA nebo miRNA a malé interferující RNA nebo siRNA. Tyto molekuly v podstatě regulují genovou expresi potlačením cílového genu. Jak miRNA, tak siRNA mají velmi podobné dráhy biogeneze, i když mezi nimi existují určité rozdíly. Původ miRNA a siRNA je z molekul dsRNA. Zralé miRNA jsou strukturálně podobné molekulám siRNA.
miRNA
Mikro RNA nebo miRNA jsou malé molekuly RNA, které zprostředkovávají poslední kontrolu translační genové regulace. Deregulace miRNA může vést k rozvoji rakoviny a dalších onemocnění. Proto je správná regulace informací zakódovaných v nekódující oblasti miRNA velmi kritická v mnoha základních buněčných procesech.
siRNA
siRNA se také označují jako krátké interferující nebo umlčující RNA a jsou tvořeny dvouvláknovou RNA s 20 až 25 páry bází. Hlavní úlohou siRNA je interferovat s expresí specifických genů s komplementárními nukleotidovými sekvencemi. siRNA je tvořena krátkou dvouvláknovou RNA s fosforylovanými 5' konci a hydroxylovanými 3' konci se dvěma převislými nukleotidy.
Jaký je rozdíl mezi siRNA a miRNA?
• miRNA odvozená ze specifických genomových lokusů, zatímco siRNA odvozená z mRNA, transpozonů, virů nebo heterochromatické DNA.
• Syntéza miRNA je zpracovávána z delších prekurzorových vlásenkových transkriptů (primární jaderná miRNA sekvence endonukleázou RNázy III), zatímco syntéza siRNA je zpracovávána z dlouhých bimolekulárních duplexů RNA.
• Každá vlásenková prekurzorová molekula miRNA produkuje jeden duplex miRNA, zatímco každá prekurzorová molekula siRNA produkuje více duplexů siRNA.
• Sekvence siRNA jsou zřídka konzervované, zatímco sekvence miRNA jsou dobře konzervované.
• Všechny báze v siRNA přispívají k její cílové specificitě, zatímco pouze 5' polovina miRNA přispívá k její cílové specificitě.
• miRNA se často váže na 3' netranslatovanou oblast cílových transkriptů, zatímco siRNA tvoří komplementární duplex kdekoli podél cílové mRNA.
• miRNA specifikuje ‚hetero- umlčování‘, zatímco siRNA se používá pro ‚automatické umlčování‘.
• miRNA funguje jako signál bránící translaci, zatímco siRNA translaci fyzicky brání.
