Klíčový rozdíl mezi Cosmidem a Phagemidem je v typu sekvencí, které obsahuje. Kosmid obsahuje místo cos a plazmid. Jedná se tedy o hybridní vektor, zatímco fagemid je plazmid, který obsahuje počátek replikace F1 fága F1.
Kosmidy a fagemidy se používají pro účely klonování, zejména pro klonování větších fragmentů DNA. Ty se hojně využívají zejména při klonování genů odpovědných za produkci různých proteinů. Kosmidy a fagemidy jsou buď replikovány samostatně jako plazmidy, nebo jsou zabaleny do virových částic a poté replikovány.
Co je to Cosmid?
Kosmid, označovaný jako hybridní plazmid, obsahuje místa cos extrahovaná z částic fága Lambda a plazmidu. Tato místa cos jsou dlouhé fragmenty DNA s 200 páry bází. Mají tedy soudržné nebo lepivé konce, které umožňují plazmidu zapadnout do virové DNA. Proto jsou místa cos životně důležitá pro balení DNA.
Jsou tři weby cos;
- místo cosN – podílí se na ničení řetězce DNA aktivitou terminázy
- stránka cosB – zabývá se držením terminálu.
- místo cosQ – podílí se na prevenci degradace DNA DNázami.
Obrázek 01: Cosmid
Kosmidy mohou také replikovat jednovláknovou DNA nebo dvouvláknovou DNA pomocí vhodného počátku replikace. Kosmidy obvykle obsahují geny antibiotické rezistence jako markery pro selekci transformantů. Použití kosmidu jako vektoru tedy může usnadnit klonování a štěpení vektoru restrikčním enzymem pak může extrahovat tyto fragmenty.
Co je to fagemid (Phasmid)?
Fagemid, také nazývaný Phasmid, je také typem hybridního vektoru. Phagemid obsahuje speciální počátek replikace označovaný jako f1 počátek replikace. Počátek replikace f1 se extrahuje z fága f1.
Fagemid dokáže replikovat jednovláknovou i dvouvláknovou DNA. Replikace může probíhat buď jako plazmid, zatímco prochází nezávislou replikací, nebo se může sbalit do fágových částic a nakonec infikovat bakteriálního hostitele E coli. Při infekci buněk E coli vyžaduje fág f1 přítomnost pilusu. Proto jsou sexuální pili důležité během balení fagemidů in vitro.
Jaké jsou podobnosti mezi Cosmidem a Phagemidem?
- Cosmid i Phagemid jsou klonovací vektory používané v technologii rekombinantní DNA.
- Kosmid a fagemid mohou replikovat jednovláknovou a dvouvláknovou DNA.
- Oba mohou podstoupit nezávislou replikaci podobně jako plazmidy.
- Cosmid a Phagemid mohou podstoupit balení in vitro a infikovat bakteriální buňky.
- Cosmid i Phagemid vyžadují pro klonování vhodný počátek replikace.
Jaký je rozdíl mezi Cosmidem a Phagemidem?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid je hybridní vektor, který obsahuje místo cos a plazmid. | Fagemid je plazmid, který obsahuje počátek replikace F1 fága F1. |
| Přítomnost webů Cos | |
| Místa Cos jsou přítomna v kosmidu a jsou nezbytná pro balení in vitro. | Weby Cos ve fagemidu chybí. |
| Přítomnost F1 Origin of Replication | |
| V kosmidu může, ale nemusí být přítomen fi počátek replikace. | F1 počátek replikace je přítomen ve fagemidu. |
| Přítomnost genů odolných vůči antibiotikům | |
| Geny rezistentní na antibiotika jsou přítomny v kosmidech k identifikaci transformantů od netransformantů. | Geny rezistentní na antibiotika ve fagemidech chybí. |
| Požadavek na balení in vitro | |
| Vyžaduje web cos. | Vyžaduje sexuální pilus. |
Shrnutí – Cosmid vs Phagemid
Cosmid a Phagemid jsou klonovací vektory používané v technologii rekombinantní DNA. Kosmidy jsou hybridní vektory, které obsahují speciální lepivé konce známé jako místa cos. balení in-vitro vyžadují tyto cos stránky. Zatímco fagemidy jsou plazmidy, které obsahují f1 počátek replikace extrahovaný z f1 fágu. Jak kosmid, tak fagemid mohou podstoupit nezávislou replikaci nebo in vitro balení do bakteriálních buněk. Toto jsou důležité rozdíly mezi kosmidem a fagemidem.
