Klíčový rozdíl mezi ORF a exonem je ten, že ORF neboli otevřený čtecí rámec je úsek sekvence DNA, který začíná místem iniciace translace (start kodon) a končí místem terminace translace (stop kodon), zatímco exon je nukleotidová sekvence v genu, který kóduje aminokyseliny.
Otevřený čtecí rámec je součástí čtecího rámce. Čtecí rámce jsou čteny ribozomy za účelem tvorby proteinů. ORF je kontinuální úsek kodonů, který poskytuje plně funkční protein. Začíná start kodonem a končí stop kodonem. Uvnitř ORF není žádný stop kodon přerušující kódující sekvenci. Translace začíná u start kodonu a končí u stop kodonu. Exon je nukleotidová sekvence genu. Kóduje aminokyseliny proteinu. Proto jsou exony kódující oblasti genu.
Co je ORF?
Otevřený čtecí rámec neboli ORF je kontinuální úsek nukleotidové sekvence, který začíná start kodonem a končí stop kodonem. Jednoduše řečeno, ORF se týká oblasti nukleotidové sekvence umístěné mezi startovacím a stop kodonem. Mezi tím neexistuje žádný stop kodon přerušující ORF. Nukleotidová sekvence mezi start a stop kodonem kóduje aminokyseliny. Obecně je start kodon ATG, zatímco stop kodony jsou TAG, TAA a TGA. ORF poskytuje funkční protein, když je transkribován a translatován. Proto ORF zahrnuje start kodon, několik kodonů ve střední oblasti a stop kodon. Zajímavé je, že ORF má délku, kterou lze dělit třemi.
Obrázek 01: ORF
U prokaryot, protože neexistují žádné introny, je ORF kódující oblast genu, která se přepisuje přímo do mRNA. V eukaryotech, protože existují introny, je ORF kodonová sekvence, která vzniká po zpracování nebo sestřihu RNA. ORF je důkazem, který pomáhá předpovídat geny, protože dlouhé ORF jsou pravděpodobně součástí genu.
Co je to exon?
Exony jsou kódující nukleotidové sekvence genů, které se překládají do proteinů. Jsou na obou stranách intronu. Po odstranění nekódujících sekvencí z pre mRNA obsahuje zralá molekula mRNA pouze exonové sekvence. Poté se nukleotidová sekvence konečné molekuly RNA (zralá mRNA) převede na aminokyselinovou sekvenci specifického proteinu.
Obrázek 02: Exony
Téměř všechny geny mají počáteční nukleotidovou sekvenci, která je odlišuje jako gen od hlavního řetězce DNA nebo RNA, který je známý jako otevřený rámec čtení (ORF. U některých genů dva ORF označují celý gen a exony I když to zní, že exony jsou vždy exprimovány v genech, existují případy, kdy intronové sekvence zasahují do exonu a způsobují mutace, a tento proces je známý jako exonizace.
Jaké jsou podobnosti mezi ORF a Exon?
- ORF i exon jsou nukleotidové sekvence.
- Dlouhý ORF a exony jsou součástí genu.
- Oba mají kódovací sekvence.
Jaký je rozdíl mezi ORF a Exon?
ORF a exon jsou nukleotidové sekvence. ORF označuje jakýkoli úsek sekvence DNA umístěný mezi start kodonem a stop kodonem. Naproti tomu exon je kódující nukleotidová sekvence genu, který kóduje aminokyseliny. Toto je klíčový rozdíl mezi ORF a exonem. Exony jsou součástí genu, zatímco dlouhý ORF je pravděpodobně součástí genu. Kromě toho existují introny na obou stranách exonu, zatímco ORF nezahrnuje introny.
Níže uvedená infografika shrnuje rozdíl mezi ORF a exonem ve formě tabulky.
Shrnutí – ORF vs Exon
Otevřený čtecí rámec (ORF) je součástí čtecího rámce. Je to kontinuální úsek sekvence DNA, který začíná start kodonem a končí stop kodonem. Exon je nukleotidová sekvence genu. Kóduje část sekvence mRNA. Exony jsou tedy části genové sekvence, které jsou exprimovány v proteinu. Toto shrnuje rozdíl mezi ORF a exonem.