Klíčový rozdíl – zakořeněný a nezakořeněný fylogenetický strom
Fylogeneze je důležitý obor, který zkoumá život na Zemi v průběhu času. Odhaluje spojení mezi organismy s jejich předky a potomky. Vztahy mezi organismy jsou schematicky reprezentovány různými stromovými reprezentacemi, jako je dendogram, kladogram, fenogram, fylogegram atd. Fylogenetický strom je větvený stromovitý diagram, který vysvětluje fylogenetické vztahy mezi organismy s množstvím evoluční vzdálenosti. Existují dva hlavní typy fylogenetických stromů známé jako zakořeněné a nezakořeněné. Klíčový rozdíl mezi zakořeněným a nezakořeněným fylogenetickým stromem je ten, že zakořeněný strom ukazuje nejzákladnějšího předka stromu, zatímco nezakořeněný fylogenetický strom nevykazuje rodový kořen.
Co je to zakořeněný fylogenetický strom?
Kořeněný fylogenetický strom slouží jako užitečný diagram, který ukazuje evoluční historii. Má bazální uzel, který se nazývá kořen a představuje společného předka všech skupin stromu. Kořen stromu je považován za nejstarší bod ve stromu, který představuje posledního společného předka všech skupin obsažených ve stromu. Zakořeněný strom tedy ukazuje směr evolučního času. Z jednoho druhu zakořeněného stromu lze nalézt společný původ nebo předchůdce druhu vysledováním zpět k bazálnímu uzlu. Protože zakořeněný strom znázorňuje směr evolučního času, je snadné najít starší nebo novější skupiny, které má. Zakořeněný strom lze použít ke studiu celých skupin organismů. Přesné zakořenění fylogenetického stromu je důležitým a zásadním faktorem, protože nepřesné zakořenění může vést k nesprávné interpretaci genetických změn mezi organismy a jejich směrovosti evoluce.
Obrázek 01: Zakořeněný fylogenetický strom
Co je nezakořeněný fylogenetický strom?
Nezakořeněný fylogenetický strom je fylogenetický diagram, který postrádá společného předka nebo bazální uzel. Tento typ stromu nenaznačuje původ evoluce zájmových skupin. Zobrazuje pouze vztah mezi organismy bez ohledu na směr evoluční časové linie. Proto je obtížné studovat evoluční vztahy skupin s ohledem na čas pomocí nezakořeněného stromu.
Existují dva hlavní způsoby, jak zakořenit nezakořeněný fylogenetický strom. Jsou
Nalezení vnější skupiny – To vyžaduje předchozí znalosti o vztazích mezi taxony. Potom lze taxon, který leží mimo skupinu, použít jako vnější skupinu k nakreslení zakořeněného fylogenetického stromu
Nalezení středu nebo vzdálenosti – Střed dvou nejvzdálenějších taxonů ve stromu lze považovat za kořen fylogenetického stromu
Obrázek 02: Nezakořeněný fylogenetický strom
Jaký je rozdíl mezi zakořeněným a nezakořeněným fylogenetickým stromem?
Zakořeněný vs nezakořeněný fylogenetický strom |
|
| Kořeněný fylogenetický strom je diagram, který ukazuje posledního společného předka skupin. | Nezakořeněný fylogenetický strom ukazuje vztahy mezi organismy, aniž by ukazoval společného předka. |
| Uzel | |
| Má uzel (kořen). | Nemá uzel. |
| Směr evoluce | |
| Má směr k označení evolučního času. | Neurčuje evoluční vztah. |
| Postoj k ostatním | |
| Strom umožňuje určit vztah předek – potomek mezi skupinami. | Strom neumožňuje mluvit o vztahu předek – potomek. |
Shrnutí – zakořeněný vs nezakořeněný fylogenetický strom
Fylogenetický strom představuje evoluční cesty a spojení mezi organismy pomocí rozvětvených stromových diagramů. Fylogenetický strom může být zakořeněný nebo nezakořeněný. Zakořeněný strom má na základně uzel představující společného předka, který spojuje všechny zájmové skupiny. Nezakořeněný strom ukazuje vztahy mezi organismy. Nezobrazuje však společného předka, kterého všechny skupiny sdílejí. Toto je rozdíl mezi zakořeněným a nezakořeněným fylogenetickým stromem.
