Klíčový rozdíl – repetitivní DNA vs satelitní DNA
Genomická DNA se skládá hlavně z kódující DNA a nekódující DNA. Kódující sekvence jsou známé jako geny. Na chromozomech jsou umístěny tisíce genů. Repetitivní DNA, introny a regulační sekvence jsou v genomu považovány za nekódující DNA. Repetitivní DNA jsou nukleotidové sekvence opakující se znovu a znovu v genomu organismů. Repetitivní DNA představuje významnou část genomové DNA a je rozdělena do tří hlavních typů nazvaných tandemové repetice, koncové repetice a vložené repetice. Tandemové repetice jsou v genomu vysoce repetitivní. Jedním typem tandemových repetic je satelitní DNA. Klíčový rozdíl mezi repetitivní DNA a satelitní DNA je ten, že repetitivní DNA jsou opakované sekvence DNA v genomu, zatímco satelitní DNA je typ repetitivní DNA, která se vysoce opakuje a nachází se většinou v heterochromatické oblasti kolem centromery.
Co je repetitivní DNA?
Opakující se DNA má opakované nukleotidové sekvence znovu a znovu. Repetitivní DNA je také známá jako repetitivní elementy nebo repetice. Repetitivní DNA zaujímá významnou část celkového genomu mnoha organismů. Lidský genom obsahuje více než dvě třetiny sekvence repetitivní DNA. Tyto nekódují proteiny a patří do kategorie nekódující DNA genomu.
Existují tři hlavní typy repetitivní DNA pojmenované terminální repetice, tandemové repetice a vložené repetice. Tandemové repetice jsou vysoce opakované sekvence, které leží vedle sebe. Existují tři typy tandemových repetic nazývaných satelitní DNA, minisatelitní DNA a mikrosatelitní DNA. Vložená repetitivní DNA je repetitivní sekvence rozptýlená po celém genomu jako jednotlivé jednotky s jedinečnými lemujícími sekvencemi. Existují dva typy rozptýlené DNA nazývané transpozony a retrotranspozony. Vznikají díky schopnosti transpozice v rámci genomu. Retrotranspozony patří k transponovatelným prvkům třídy 1 a při integraci do genomu se řídí mechanismem kopírování a vkládání. Transpozony patří do třídy 2 transponovatelných prvků, protože se pohybují podél genomu pomocí mechanismu vyjmutí a vložení.
Přestože repetitivní DNA není kódována pro proteiny, jsou důležité pro různé funkce v genomu. Repetitivní DNA je nezbytná pro formátování exprese jedinečných kódujících sekvencí a pro poskytování dalších funkcí potřebných pro replikaci genomu a přesný přenos do dceřiných buněk atd. Repetitivní DNA také poskytuje významnou část lešení nebo oblastí pro připojení matrice, což ukazuje její nezbytnost při organizování genomu organismů.
Co je satelitní DNA?
Satelitní DNA je druh repetitivní DNA, která se vysoce opakuje. Patří do kategorie repetitivní DNA nazývané tandemové repetice. Satelitní DNA se tandemově opakují a nacházejí se v oblasti centromery a telomer chromozomů. Jedna krátká opakující se jednotka satelitní DNA se pohybuje od 5 do 300 párů bází, v závislosti na druhu. Normálně se v genomu opakují 105 až 106 krát. V savčím genomu tvoří satelitní DNA 10 – 20 % frakce.
Satelitní DNA nekóduje proteiny a nepřenáší funkční genetickou informaci. Přispívají k chromozomální organizaci, protože slouží jako hlavní komponenta funkčních centromer a jako hlavní strukturální složka heterochromatinu.
Satelitní DNA se liší v hustotě od většiny DNA. Během ultracentrifugace tedy poskytuje samostatný pás. Existují různé typy satelitní DNA známé jako alphoidní DNA, beta, satelit 1, satelit 2, satelit 3 atd.
Obrázek 01: Opakující se DNA a satelitní DNA
Jaký je rozdíl mezi repetitivní DNA a satelitní DNA?
Opakující se DNA vs satelitní DNA |
|
Opakující se DNA jsou nukleotidové sekvence mnohokrát opakované v genomu organismů. | Satelitní DNA je jeden typ repetitivní DNA, která se v genomu opakuje milionkrát. |
Typy | |
Existují tři hlavní typy, jako jsou koncové opakování, tandemové opakování a proložené opakování. | Satelitní DNA je klasifikována do různých typů, jako je alphoid, beta, saterllite1, 2 a 3 atd. |
Umístění | |
Opakující se DNA se nachází v celém genomu. | Satelitní DNA se nachází v oblasti centromery a telomer chromozomu. |
Shrnutí – Opakující se DNA vs satelitní DNA
Genomy jsou organizovány do různých typů DNA. Kódující sekvence mezi nimi jsou uloženy s genetickou informací pro syntézu proteinů. Jiné nekódující sekvence poskytují strukturální a další funkce pro replikaci DNA, udržování struktury chromozomů atd. Repetitivní DNA je typ nekódující DNA, která se v genomu stále znovu opakuje. Repetitivní DNA má různé typy a satelitní DNA, která se nachází v oblasti centromery a telomer chromozomů, je jedním z nich. To je rozdíl mezi repetitivní DNA a satelitní DNA.
Stáhnout PDF verzi repetitivní DNA vs satelitní DNA
Můžete si stáhnout PDF verzi tohoto článku a použít ji pro offline účely podle citací. Stáhněte si PDF verzi zde Rozdíl mezi repetitivní DNA a satelitní DNA – PDF.