Klíčový rozdíl mezi homodimerem a heterodimerem je ten, že homodimer je protein vyrobený ze dvou identických proteinů, zatímco heterodimer je protein vyrobený ze dvou různých proteinů.
Protein je biomolekula složená z řetězců aminokyselin. Proteinový dimer je kvartérní proteinová struktura vytvořená spojením dvou proteinových monomerů nebo dvou aminokyselinových řetězců. Obecně se navzájem vážou nekovalentními vazbami. Proteinové dimery jsou buď homodimery nebo heterodimery. Homodimer má dva identické proteiny, které jsou nekovalentně vázané. Heterodimer má dva různé proteiny vázané dohromady. Tato interakce proteinového dimeru je důležitá při regulaci a katalýze.
Co je homodimer?
Homodimer je typ proteinového dimeru složený ze dvou identických monomerů. Monomery se vážou nekovalentními vazbami. Obecně existuje 18 středních počtů H vazeb v homodimerech. Navíc korelační koeficient mezi H-vazbami a zbytky rozhraní v homodimeru je 0,85. Navíc maximální počet H vazeb na zbytek na rozhraní homodimeru je 0,44. Nejen to, ale v homodimerech je také více intermolekulárních vazeb H. Hustota H vazeb na zbytek rozhraní je však u homodimerů nižší.
Obrázek 01: Homodimer
Při zvažování příkladů homodimerů jsou RNA třídy 1 homodimery. V tomto homodimeru je protein R1 odpovědný za redukci nukleotidů, zatímco protein R2 je zodpovědný za umístění diželezného tyrosylového pole. Dalším proteinovým homodimerem je tyreoglobulin produkovaný štítnou žlázou. Xanthinoxidáza a etanercept jsou také homodimery proteinů.
Co je heterodimer?
Heterodimer je typ proteinového dimeru složený ze dvou neidentických monomerů. Jinými slovy, heterodimer je protein složený ze dvou různých proteinových monomerů. Obecně existuje 12 středních počtů H vazeb v heterodimerech. Navíc korelační koeficient mezi H-vazbami a zbytky rozhraní v heterodimeru je 0,83. Navíc maximální počet H vazeb na zbytek na rozhraní heterodimeru je 0,65. Ve srovnání s homodimery je v heterodimerech méně intermolekulárních H vazeb. Hustota vazeb H na zbytek rozhraní je však vyšší u heterodimerů.
Obrázek 02: Heterodimer
Enzymová reverzní transkriptáza je heterodimer složený ze dvou různých aminokyselinových řetězců. Dalším příkladem heterodimeru jsou opioidní receptory. Kromě toho je tubulin heterodimerní protein.
Jaké jsou podobnosti mezi homodimerem a heterodimerem?
- Homodimer a heterodimer jsou dva typy proteinových stmívačů.
- Oba mají dva monomery.
- Jsou to kvartérní proteinové struktury.
- Dimery jsou běžné v katalýze a regulaci.
Jaký je rozdíl mezi homodimerem a heterodimerem?
Homodimer je proteinový dimer složený ze dvou identických proteinových monomerů, zatímco heterodimer je proteinový dimer složený ze dvou různých proteinových monomerů. Toto je klíčový rozdíl mezi homodimerem a heterodimerem. Dále je v homodimerech 18 středních počtů H vazeb, zatímco v heterodimerech je 12 středních počtů H vazeb.
Další rozdíl mezi homodimerem a heterodimerem je v tom, že korelační koeficient mezi H-vazbami a zbytky rozhraní je 0,85 u homodimerů, zatímco u heterodimerů je 0,83.
Níže uvedená infografika rozdílu mezi homodimerem a heterodimerem ukazuje více srovnání mezi oběma dimery.
Shrnutí – Homodimer vs Heterodimer
Proteinové dimery jsou běžné při katalýze a regulaci. Mohou to být buď homodimery nebo heterodimery. Homodimery se skládají ze dvou identických proteinových monomerů. Naproti tomu heterodimery jsou složeny ze dvou neidentických proteinových monomerů. Toto je klíčový rozdíl mezi homodimerem a heterodimerem.
