Klíčový rozdíl mezi signální sekvencí a signální záplatou je v tom, že signální sekvence je aminokyselinová sekvence v proteinech, která pomáhá buňce přimět k translokaci proteinů do organel nebo buněčné membrány, zatímco signální záplata je aminokyselinová sekvence v proteiny, které pomáhají přimět buňku k translokaci proteinů z cytosolu do jádra.
Protein targeting neboli třídění je biologický mechanismus, kterým jsou proteiny transportovány na jejich vhodná místa v buňce nebo mimo ni. Informace, které jsou obsaženy v samotném proteinu, řídí tento proces dodávání. Správné třídění bílkovin je pro buňku klíčové. Chyby nebo dysfunkce při třídění mohou způsobit řadu onemocnění. Signální sekvence a signální záplata jsou dvě sekvence tvořené aminokyselinami v proteinech, které se podílejí na zacílení nebo třídění proteinů.
Co je to signálová sekvence?
Signální sekvence je aminokyselinová sekvence v proteinech, která vybízí buňku k translokaci proteinů, obvykle do organel nebo buněčné membrány. Signální sekvence je také známá jako signální peptid. Je to krátký peptid, který obsahuje 16 až 30 aminokyselin. Je přítomen na N konci (občas C konci) většiny nově syntetizovaných proteinů. Signální sekvence pomáhá proteinům směrem k sekrečním drahám. Mezi proteiny, které obsahují signální sekvence, patří ty, které se nacházejí uvnitř organel (endoplazmatické retikulum, Golgiho aparát nebo endozomy), secernované z buňky nebo vložené do většiny buněčných membrán.
Obrázek 01: Sekvence signálu
Normálně má většina membránově vázaných proteinů typu I signální sekvence. Většina proteinů typu II a multispanning membránově vázaných proteinů je však zaměřena na sekreční dráhu svou první transmembránovou doménou známou jako „cílový peptid“. Navíc u prokaryot signální sekvence směrují nově syntetizované proteiny do kanálu vedoucího protein SecYEG, který je přítomen v plazmatické membráně. Navíc u eukaryot existuje homologní systém, kde signální sekvence směrují nově syntetizované proteiny do kanálu Sec61. Ačkoli tento kanál sdílí strukturální a sekvenční homologii se SecYEG, je přítomen v endoplazmatickém retikulu.
Co je to signální oprava?
Signální záplata je aminokyselinová sekvence v proteinech, která vybízí buňku k translokaci proteinů z cytosolu do jádra. Signální záplata obsahuje informace k odeslání daného proteinu na určené místo v buňce. S největší pravděpodobností signální cesta směřuje protein z cytosolu do jádra. Skládá se z aminokyselinových zbytků, které jsou od sebe vzdálené v primární sekvenci. Tyto aminokyseliny se však nacházejí blízko sebe v terciární struktuře složeného proteinu.
Obrázek 02: Signal Patch
Na rozdíl od signálních sekvencí nejsou signální oblasti po procesu třídění ze zralého proteinu odštěpeny. Patche signálu je velmi těžké předvídat. Jaderné lokalizační signály jsou obecně signální záplaty, ačkoli existují také některé signální sekvence. Kromě toho se na proteinech určených pro jádro nacházejí signální skvrny, které umožňují jejich selektivní transport z cytosolu do jádra přes komplexy jaderných pórů.
Jaké jsou podobnosti mezi sekvencí signálu a patchem signálu?
- Signální sekvence a signální patch jsou dvě sekvence zapojené do cílení nebo třídění proteinů.
- Obě sekvence jsou přítomny uvnitř proteinů.
- Tyto sekvence jsou krátké aminokyselinové sekvence.
- Chyby v obou sekvencích mohou způsobit dysfunkci při třídění proteinů, což má za následek řadu onemocnění.
Jaký je rozdíl mezi sekvencí signálu a patchem signálu?
Signální sekvence je aminokyselinová sekvence nalezená v proteinech, která vybízí buňku k translokaci proteinů do organel nebo buněčné membrány, zatímco signální záplata je aminokyselinová sekvence nalezená v proteinech, která pobízí buňku k translokaci proteinů obvykle z cytosolu do jádra. Toto je klíčový rozdíl mezi signální sekvencí a signálním patchem. Dále je signální sekvence štěpena zralými proteiny po třídění, zatímco signální náplast není štěpena zralými proteiny po třídění.
Následující tabulka shrnuje rozdíl mezi signálovou sekvencí a signálovým patchem.
Shrnutí – Sekvence signálu vs. Patch signálu
Signální sekvence a signální patch jsou dvě sekvence nalezené v proteinech. Jsou nezbytné pro cílení nebo třídění proteinů. Signální sekvence vyzve buňku k translokaci proteinů, obvykle do organel nebo buněčné membrány. Na druhé straně signální náplast vyzve buňku k translokaci proteinů, obvykle z cytosolu do jádra. Toto je klíčový rozdíl mezi signálovou sekvencí a signálovým patchem.
