Klíčový rozdíl mezi TATA a CAAT boxem je v tom, že TATA box je konzervovaná nukleotidová oblast, která má konsenzuální sekvenci TATAWAW, zatímco CAAT box je konzervovaná nukleotidová oblast s konsenzuální sekvencí GGCCAATCT.
TATA box a CAAT box jsou dvě oblasti nukleotidů, které ovlivňují transkripci eukaryotických genů. Jsou to nekódující sekvence DNA nacházející se proti směru transkripce od místa iniciace transkripce. Ve skutečnosti se nacházejí v regulační oblasti, která je známá jako promotor. Jak TATA box, tak CAAT box jsou zodpovědné za účinnost transkripce. Jsou to konsensuální sekvence, které se během evolučního procesu nezměnily.
Co je TATA Box?
TATA box nebo Goldberg-Hogness box je konsensuální sekvence nalezená v promotorové oblasti eukaryotických genů. TATA box je základním prvkem promotoru. Nachází se 25 párů bází proti směru transkripce od místa iniciace transkripce. Zachovává se po celý evoluční proces. Konsenzuální sekvence TATA boxu je TATAWAW, kde W je buď A nebo T. Je to nekódující sekvence DNA. TATA box je však důležitý pro transkripci genu. Je vazebným místem TATA-binding proteinu (TBP) a dalších transkripčních faktorů. Jakmile se navážou do TATA boxu, dojde v eukaryotických genech k náboru RNA polymerázy II a správné regulaci transkripce.
Obrázek 01: TATA Box
Jelikož se TATA box podílí na regulaci transkripce, mohou mutace TATA boxu vést k fenotypovým změnám vedoucím k onemocněním, jako je rakovina žaludku, spinocerebelární ataxie, Huntingtonova choroba, slepota, β-talasémie, imunosuprese, Gilbertův syndrom, a HIV-1 atd.
Co je CAAT Box?
CAAT box je oblast nukleotidů s konsenzuální sekvencí GGCCAATCT. Podobně jako TATA box je CAAT box také umístěn v promotorové oblasti genu. Proto se nachází asi 75-80 párů bází proti směru transkripce od místa transkripce.
Obrázek 02: CAAT Box
Specifické transkripční faktory se vážou na pole CAAT. Tato vazba stabilizuje preiniciační komplex pro snadnější vazbu enzymu RNA polymerázy. Stejně tak box CAAT funguje jako regulační sekvence. Mutace v oblasti CAAT boxu vysoce ovlivňují odpověď promotoru a regulaci transkripce.
Jaké jsou podobnosti mezi TATA a CAAT Box?
- TATA a CAAT jsou dvě oblasti nukleotidů nacházející se v regulační sekvenci eukaryotických genů.
- Nacházejí se před místem zahájení transkripce.
- Obě jsou konsensuální sekvence DNA.
- Jsou nezbytné pro regulaci transkripce, jsou to tedy regulační sekvence.
Jaký je rozdíl mezi TATA a CAAT Box?
TATA box je konzervovaná nukleotidová oblast nacházející se asi 25-30 párů bází proti směru transkripce od místa iniciace transkripce. Na druhé straně, CAAT box je konzervovaná oblast nukleotidů nacházející se asi 75-80 párů bází proti směru transkripce od místa iniciace transkripce. Toto je klíčový rozdíl mezi boxem TATA a CAAT. Kromě toho má TATA box konsenzuální sekvenci TATAWAW, zatímco GGCCAATCT je konsenzuální sekvence CAAT boxu.
Dalším významným rozdílem mezi TATA a CAAT boxem je navíc to, že TATA box poskytuje vazebné místo pro TBP a transkripční faktory a podílí se na regulaci transkripce, zatímco box CAAT signalizuje vazebné místo pro RNA transkripční faktor.
Níže uvedená infografika shrnuje rozdíly mezi boxem TATA a CAAT.
Shrnutí – TATA vs CAAT Box
TATA box a CAAT box jsou dvě části konzervované oblasti promotorů eukaryotických genů. Jsou umístěny proti směru transkripce od místa iniciace transkripce. Oba ovlivňují transkripci genů tím, že poskytují místa pro vazbu TATA-vazebných proteinů a transkripčních iniciačních faktorů. TATA box je umístěn 25-35 párů bází proti směru transkripce od místa iniciace transkripce, zatímco box CAAT je umístěn 75-80 párů bází proti směru transkripce od místa iniciace transkripce. Konsenzuální sekvence TATA boxu je TATAWAW, zatímco konsenzuální sekvence CAAT boxu je GGCCAATCT. Toto je shrnutí rozdílu mezi TATA a CAAT boxem.
