Klíčový rozdíl mezi restrikčními enzymy EcoRI a HindIII je v tom, že EcoRI je restrikční enzym typu II, který je izolován z E. coli, zatímco HindIII je restrikční enzym typu II, který je izolován z Haemophilus influenza.
Restrikční enzym nebo restrikční endonukleáza je enzym, který štěpí DNA na fragmenty ve specifických rozpoznávacích místech (restrikčních místech) v molekule DNA. Tyto restrikční enzymy se nacházejí v bakteriích a archeích. Poskytují obranný mechanismus proti napadajícím virům. Restrikční enzymy jsou obecně klasifikovány do pěti různých typů: typ I, typ II, typ III, IV a typ V. EcoRI a HindIII jsou dva restrikční enzymy, které patří do skupiny restrikčních enzymů typu II.
Co jsou to omezovací enzymy EcoRI?
EcoRI je restrikční enzym typu II, který je izolován z druhů E.coli. Jde o restrikční enzym, který štěpí dvoušroubovice DNA na fragmenty na specifických místech. EcoRI je také součástí restrikčně-modifikačního systému. EcoRI byl první enzym, který byl původně izolován z kmene RY13 druhu E. coli. Používá se jako restrikční enzym v molekulární biologii. EcoRI vytváří 4 nukleotidové lepivé konce s 5'koncovými přesahy AATT. EcoRI štěpí DNA ve specifické rozpoznávací sekvenci G↓AATTC. Má palindromickou komplementární sekvenci CTTAA↓G. Navíc tento restrikční enzym patří do podtřídy typu II P (palindromická specificita). Ve své primární struktuře obsahuje EcoRI motiv PD. D/EXK ve svém aktivním místě, stejně jako mnoho dalších restrikčních enzymů.
Obrázek 01: EcoRI
Restrikční enzym EcoRI je homodimer o velikosti 31 kDa. Obsahuje jednu globulární doménu architektury α/β. Každá podjednotka obsahuje smyčku, která vyčnívá z globulární domény a ovine se kolem DNA, když je navázána. Tento enzym může být kokrystalizován se sekvencí, kterou normálně štěpí. Kromě toho se restrikční enzym EcoRI používá v široké škále molekulárně genetických technik, včetně klonování, screeningu DNA a delečních sekcí DNA in vitro podmínek.
Co jsou restrikční enzymy HindIII?
HindIII je restrikční enzym typu II, který je izolován z druhů Haemophilus influenza. Štěpí palindromickou sekvenci DNA AACCTT v přítomnosti kofaktoru Mg2+ hydrolýzou. Štěpení této konkrétní sekvence mezi AA’S (5’A↓ACCTT3’ a 3’TTCGA↓A5’) má za následek 5’ převisy na molekule DNA nazývané lepkavé konce. Tento enzym se nachází v prokaryotických organismech, jako jsou bakterie. Bakterie používají tento enzym jako obranný mechanismus proti virům, jako jsou bakteriofágy.
Obrázek 02: HindIII
Strukturálně je HindIII homodimer. Obsahuje společné strukturní jádro obsahující čtyři β listy a jeden α šroubovice, jako jiné typy II restrikčních enzymů. Molekulová hmotnost tohoto enzymu je 34,9 kDa. Kromě toho je HindIII velmi užitečný v moderních molekulárně biologických vědeckých experimentech, jako je sekvenování a mapování DNA.
Jaké jsou podobnosti mezi restrikčními enzymy EcoRI a HindIII?
- EcoRI a HindIII jsou dva restrikční enzymy patřící do skupiny restrikčních enzymů typu II.
- EcoRI a HindIII byly nalezeny na počátku 70. let.
- EcoRI a HindIII oba obsahují motiv aminokyselinové sekvence PD.. D/EXK.
- Oba restrikční enzymy provádějí velmi specifické štěpení DNA.
- Tyto restrikční enzymy potřebují Mg2+ jako kofaktor pro svou specifickou aktivitu.
- Po rozříznutí DNA vytvářejí lepkavé konce.
- Jsou velmi užitečné komponenty v moderním molekulárně biologickém výzkumu.
Jaký je rozdíl mezi restrikčními enzymy EcoRI a HindIII?
EcoRI je restrikční enzym typu II, který je izolován z druhů E.coli, zatímco HindIII je restrikční enzym typu II, který je izolován z druhů Haemophilus influenza. Toto je klíčový rozdíl mezi EcoRI a HindIII. Kromě toho EcoRI štěpí DNA ve specifické rozpoznávací sekvenci G↓AATTC, zatímco HindIII štěpí DNA ve specifické rozpoznávací sekvenci A↓ACCTT.
Níže uvedená infografika představuje rozdíly mezi EcoRI a HindIII ve formě tabulky pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – EcoRI vs. Restrikční enzymy HindIII
EcoRI a HindIII jsou dva restrikční enzymy, které patří do podtřídy p typu II. Provádějí velmi specifické štěpení DNA. EcoRI je restrikční enzym typu II, který je izolován z druhů E. coli, zatímco HindIII je restrikční enzym typu II, který je izolován z druhů Haemophilus influenza. Toto shrnuje rozdíl mezi EcoRI a HindIII.
