Klíčový rozdíl – obecné versus specifické transkripční faktory
Trankripční faktory jsou vyžadovány RNA polymerázou, aby působily na vlákno templátu DNA při syntéze mRNA. Existují různé typy transkripčních faktorů. Tyto transkripční faktory tvoří komplex s řetězcem DNA. Buď mění potvrzení templátového řetězce nebo zvyšují afinitu enzymu RNA polymerázy k syntéze mRNA v procesu zvaném transkripce. Existují dva hlavní typy transkripčních faktorů. Jsou to obecné nebo bazální transkripční faktory a specifické transkripční faktory. Obecné transkripční faktory jsou faktory používané k vytvoření pre-iniciačního komplexu během procesu transkripce. Jsou přítomny téměř ve všech eukaryotech a v prokaryotech tvoří méně komplikovaný komplex. Specifické transkripční faktory jsou buď zesilovače nebo represory, což jsou specifické sekvence DNA, které aktivují nebo potlačují obecný proces transkripce. Některé specifické transkripční faktory mohou změnit samotnou sekvenci DNA. Klíčový rozdíl mezi obecnými transkripčními faktory a specifickými transkripčními faktory je založen na funkčnosti. Obecné transkripční faktory se podílejí na tvorbě pre-iniciačního komplexu transkripčního procesu, zatímco specifické transkripční faktory se účastní buď aktivace nebo potlačení transkripčního procesu.
Co jsou obecné transkripční faktory?
Obecné nebo bazální transkripční faktory jsou faktory, které se podílejí na tvorbě iniciačního komplexu během transkripce. Jsou nezbytné pro proces transkripce, a proto hrají zásadní roli v úspěšné transkripci. Existuje šest klíčových obecných transkripčních faktorů. Oni jsou; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF a TFIIA. Při vytváření iniciačního komplexu hrají různé role.
- TFIID – Tento transkripční faktor (TF) se podílí na rozpoznávání promotorové sekvence (TATA box).
- TFIIB – Komplex promotor/TFIID rozpoznává TFIIB. To poskytuje signál pro vazbu hlavního katalyzujícího enzymu RNA polymerázy.
- TFIIF – Tento transkripční faktor je vázán na RNA polymerázu. TFIIF se tedy účastní procesu rekrutováním RNA polymerázy na správné místo.
- TFIIE a TFIIH – Vazba těchto transkripčních faktorů značí konec tvorby pre-iniciačního Vazba těchto zvyšuje efektivitu tvorby pre-iniciačního komplexu.
- TFIIA podporuje vazbu TFIID na TATA box.
Obrázek 01: Obecné transkripční faktory
Výše uvedené obecné transkripční faktory jsou specifické pro RNA polymerázu II, což je typ RNA polymerázy, která prodlužuje řetězec mRNA. S RNA polymerázou I a III se podílejí obecné transkripční faktory. Obecné transkripční faktory se také mohou lišit podle typu buňky, na kterou působí.
Co jsou specifické transkripční faktory?
Specifické transkripční faktory jsou oblasti, které se nacházejí také v sekvencích DNA. Jsou to většinou buď zesilovače nebo represory. Specifické transkripční faktory jsou specifické cis-působící elementy v templátovém řetězci DNA, které podléhají transkripci. Aktivace těchto specifických zesilovačů a represorů se podílí na zvýšení afinity enzymu změnou orientace molekuly DNA nebo působením jako signální oblasti. Specifické transkripční faktory se také používají k indukci modifikací templátového řetězce DNA. Tyto modifikace zahrnují hlavně kovalentní modifikace, jako je methylace. Tím methylované oblasti DNA působí jako speciální zesilovače nebo represory procesu transkripce.
Obrázek 02: Specifické transkripční faktory
Konkrétní transkripční faktory závisí na typu druhu a běžně se nevyskytují u všech eukaryot. Tyto transkripční faktory jsou aktivovány různými metabolickými podmínkami prostřednictvím signálních transdukčních drah. Po aktivaci regulují expresi genu na transkripční úrovni.
Jaké jsou podobnosti mezi obecnými a specifickými transkripčními faktory?
- V procesu přepisu jsou vyžadovány oba faktory.
- Oba faktory ovlivňují genovou expresi organismu.
- Oba faktory pomáhají regulovat funkci RNA polymerázy v procesu transkripce.
- Oba faktory se vyskytují převážně u eukaryot.
Jaký je rozdíl mezi obecnými a specifickými transkripčními faktory?
Obecný vs. specifický přepis |
|
| Obecné transkripční faktory jsou faktory, které se používají k vytvoření pre-iniciačního komplexu během procesu transkripce. | Specifické transkripční faktory jsou buď zesilovače nebo represory, což jsou specifické sekvence DNA, které aktivují nebo potlačují obecný proces transkripce. |
| Typ molekuly | |
| Obecné transkripční faktory jsou založeny na proteinech. | Specifické transkripční faktory jsou nukleotidové sekvence. |
| Formation | |
| Obecné transkripční faktory tvoří pre-iniciační komplex během iniciace transkripce. | Specifické transkripční faktory působí jako zesilovače nebo represory transkripce. |
| Typy | |
| Existuje šest hlavních typů; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE a TFIIA obecných transkripčních faktorů. | Specifické transkripční faktory jsou hlavně kategorizovány jako enhancery a represory. |
Shrnutí – obecné vs. specifické transkripční faktory
Trankripční faktory jsou nezbytné pro regulaci transkripce a jsou nutné pro zvýšení účinnosti a přesnosti procesu. Transkripční faktory jsou dva hlavní typy; Obecné /Bazální a Specifické. Obecné transkripční faktory se podílejí na tvorbě pre-iniciačního komplexu během transkripce, zatímco specifické transkripční faktory jsou oblasti v samotné DNA, které působí jako zesilovače nebo represory. Obecné transkripční faktory jsou založeny na proteinech a vyžadují je všechna eukaryota. Nemění se široce a zůstává jako jednotné molekuly. Konkrétní transkripční faktor se může široce lišit a závisí na genetické výbavě jednotlivců. Toto je rozdíl mezi obecnými a specifickými transkripčními faktory.
Stáhněte si PDF verzi obecných a specifických transkripčních faktorů
Můžete si stáhnout PDF verzi tohoto článku a použít ji pro offline účely podle citace. Stáhněte si prosím PDF verzi zde Rozdíl mezi obecnými a specifickými transkripčními faktory
