Klíčový rozdíl – eukaryotické vs prokaryotické promotory
Trankripce je proces přeměny genetické informace uložené v kódující sekvenci DNA na sekvenci mRNA. Tento proces zahajuje specifická oblast DNA umístěná na 5' konci transkripční jednotky. Tato oblast je známá jako oblast promotoru. Tyto promotory se typicky nacházejí v blízkosti místa začátku transkripce. Délka promotoru se pohybuje od 100 bp do 1000 bp. Promotory se liší podle typu organismu. Eukaryotické a prokaryotické promotory se od sebe liší. U prokaryot se nacházejí pouze tři typy promotorových sekvencí, a to -10 promotorů, -35 promotorů a upstream elementy. V eukaryotech existuje mnoho různých promotorových prvků, jako je TATA box, iniciátorové prvky, GC box, CAAT box atd. Toto je klíčový rozdíl mezi eukaryotickými a prokaryotickými promotory.
Co jsou eukaryotické promotory?
Tři hlavní porce; jádrový promotor, proximální promotor a distální promotor společně tvoří promotor. V kontextu eukaryot bylo nalezeno mnoho promotorových prvků, které jsou vysoce sofistikované a rozmanitější než promotory. Bylo zjištěno, že díky této složitosti eukaryotických promotorů má DNA schopnost skládat se zpět na sebe. To také vysvětluje skutečnost, že k účinku mnoha regulačních sekvencí dochází, i když jsou umístěny mnoho kilobází daleko od místa transkripce. Tyto eukaryotické promotory mají schopnost překlenout širokou škálu sekvencí DNA.
Obrázek 01: Eukaryotický promotor
Příklady některých eukaryotických promotorů jsou Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box atd. V kontextu TATA boxu je to sekvence 5' – TATAA -3', která je přítomna v jádře promotérský region. Na TATA box jsou vázány proteiny transkripčních faktorů a histonové proteiny. Vazba proteinů transkripčních faktorů na TATA box napomáhá vazbě RNA polymerázy, která pak vede k tvorbě transkripčního komplexu. Jednoduše řečeno, vazba těchto proteinů bude řídit proces transkripce. Tento proces bude inhibován, když se histonové proteiny navážou na TATA box. Proto je TATA box důležitým promotorovým prvkem, který se podílí na regulaci rychlosti eukaryotické transkripce.
Co jsou prokaryotické promotory?
U prokaryotických organismů je promotor, který se účastní transkripce, identifikován přidruženým faktorem zvaným sigma faktor. Sigma faktory jsou jedinečné pro různé promotorové sekvence. Proto se říká, že každý jednotlivý sigma faktor rozpozná jednu jádrovou promotorovou sekvenci. Toto je jedinečná vlastnost, která je přítomna v procesu prokaryotické transkripce. Jak RNA polymeráza, tak sigma faktor společně identifikují správnou promotorovou oblast a tvoří transkripční komplex.
Prokaryotický promotor obsahuje pouze tři typy promotorových prvků. Menší zapojení promotorových elementů v prokaryotech je hlavním důvodem, proč je jejich transkripční proces méně sofistikovaný ve srovnání s eukaryotickou transkripcí, která zahrnuje vyšší počet promotorových sekvencí. Ze tří promotorových elementů prokaryot jsou dvě hlavní důležité dvě krátké sekvence DNA. Tyto sekvence jsou klasifikovány podle jejich umístění. Jsou to -10 promotory nebo element (který je přítomen 10 bp upstream od místa startu transkripce), -35 promotorů nebo element (to je přítomen 35 bp upstream od místa startu transkripce).
Obrázek 02: Prokaryotický promotor
Promotor -10 je ekvivalentní eukaryotickému TATA boxu nebo Pribnow boxu a je základní složkou pro iniciaci transkripce u prokaryot. Promotor -35 se skládá ze sekvence, kterou je TTGACA, která se aktivně podílí na regulaci rychlosti prokaryotické transkripce.
Jaké jsou podobnosti mezi eukaryotickými a prokaryotickými promotory?
- U obou typů jsou promotory řízeny různými regulačními sekvencemi DNA, které zahrnují zesilovače, tlumiče, izolátory a hraniční prvky.
- Promotory jsou sekvence, které iniciují transkripci u prokaryot a eukaryot.
- Promotory jsou sekvence DNA.
Jaký je rozdíl mezi eukaryotickými a prokaryotickými promotory?
Eukaryotické vs prokaryotické promotory |
|
| Eukaryotické promotory jsou regulační sekvence, které iniciují transkripci eukaryotických organismů. | Prokaryotické promotory jsou regulační sekvence, které iniciují transkripci prokaryotických genů. |
| Prvky | |
| Prokaryotický promotor se skládá z prvků upstream, -10 prvků a -35 prvků. | Eukaryotický promotor se skládá z Pribnowova boxu (TATA box), CAAT boxu, GC boxu a iniciačních prvků. |
Shrnutí – Eukaryotické vs prokaryotické promotory
Promotor je oblast DNA, která zahrnuje zahájení procesu zvaného transkripce. Tyto promotory se typicky nacházejí proti směru transkripce od místa startu transkripce. Tři hlavní části, které tvoří promotor, jsou jádrový promotor, proximální promotor a distální promotor. V kontextu eukaryot je v promotorové oblasti mnoho promotorových prvků, které jsou vysoce sofistikované a rozmanitější než prokaryota. Příklady některých eukaryotických promotorových elementů jsou Pribnowův box (TATA box), GC box, CAAT box atd. U prokaryot jsou dva hlavní důležité promotorové elementy, a to -10 element (který je přítomen 10 bp proti směru transkripce od místa začátku transkripce), -35 elementů (to je přítomno 35 bp upstream od místa startu transkripce). -10 promotor iniciuje transkripci a -35 promotor reguluje transkripci. Oba typy promotorů jsou řízeny různými regulačními sekvencemi DNA, které zahrnují zesilovače, tlumiče, izolátory a hraniční prvky. To je rozdíl mezi eukaryotickými a prokaryotickými promotory.
Stáhněte si PDF eukaryotické vs prokaryotické promotory
Verzi tohoto článku si můžete stáhnout ve formátu PDF a použít ji pro offline účely podle citace. Stáhněte si prosím PDF verzi zde: Rozdíl mezi eukaryotickým a prokaryotickým promotorem
