Klíčový rozdíl – oligonukleotid vs polynukleotid
Nukleotidy jsou základní strukturní jednotky, které syntetizují složité polymerní formy DNA (nukleová kyselina deoxyribóza) a RNA (nukleová kyselina ribóza). Nukleotidy jsou organické molekuly. Jsou složeny ze tří základních podjednotek: dusíkaté báze, pentózového cukru (ribóza/deoxyribóza) a fosfátové skupiny. DNA a RNA syntetizované z nukleotidů působí jako základní biomolekuly v živém systému. Existuje mnoho typů nukleotidů, včetně oligonukleotidů a polynukleotidů. Oligonukleotidy jsou krátké segmenty DNA a RNA s jedním nebo více nukleotidovými monomery, zatímco polynukleotidy jsou biopolymery s 13 nebo více nukleotidovými monomery. Toto je klíčový rozdíl mezi oligonukleotidy a polynukleotidy.
Co je to oligonukleotid?
Krátké segmenty molekul DNA a RNA jsou známé jako oligonukleotidy. Jsou široce používány v oblasti forenzní vědy, genetiky a výzkumu. Oligonukleotidy mohou být produkovány procesem známým jako chemická syntéza na pevné fázi prováděná v laboratoři. Jsou produkovány jako jednořetězcové molekuly se sekvencí, která je specifikována pro konkrétní funkci a je důležitým aspektem v kontextu PCR (polymerázová řetězová reakce), DNA microarrays, Southern blot techniky, FISH (fluorescenční in situ hybridizace), syntézy umělé geny, produkce knihoven DNA/RNA a fungují jako molekulární sondy.
Obrázek 01: Oligonukleotid
Oligonukleotidy se přirozeně vyskytují jako mikroRNA, malé molekuly RNA, které regulují genovou expresi. Oligonukleotidy mohou být také přítomny v důsledku katabolismu větších nukleových kyselin. Celá molekula je charakterizována a vyvinuta sekvencí nukleotidových zbytků. Oligonukleotidy složené z fragmentů DNA se využívají během PCR, což je proces, při kterém může být nepatrné množství DNA amplifikováno do milionů kopií. Oligonukleotidy zde působí jako primery, které pomáhají při fungování DNA polymerázy. Chemicky nebo přirozeně modifikovaný nukleosid známý jako fosforamidit působí jako hlavní složka během syntézy oligonukleotidů. K syntéze oligonukleotidového řetězce dochází od 3' konce k 5' konci v cyklické dráze označované jako syntetický cyklus. Po dokončení jednoho syntetického cyklu je do rostoucího řetězce přidán jeden nukleotid.
Co je to polynukleotid?
Polynukleotidová molekula se skládá z 13 nebo více nukleotidových monomerů a označuje se jako biopolymer. Monomery jsou navázány na nukleotidový řetězec kovalentně. DNA a RNA jsou příklady polynukleotidů. Nejjednodušším polynukleotidem v živém systému je RNA (ribonukleová kyselina), která obsahuje pentózový cukr ribózu. RNA se skládá z jednořetězcového polynukleotidu. Molekula se skládá ze čtyř dusíkatých bází, adeninu, guaninu, cytosinu a uracilu. RNA je mnoha různých typů: mRNA (messenger RNA), rRNA (ribozomální RNA), tRNA (transferová RNA).
Deoxyribózová nukleová kyselina (DNA) je další polynukleotid, který se skládá z pentózového cukru deoxyribózy. Dusíkaté báze jsou adenin, guanin, thymin a cytosin a jsou složeny ze dvou helikálně uspořádaných polynukleotidových řetězců. Adenin pár s thyminem a guanin pár s cytosinem. Toto se nazývá komplementární párování bází.
Obrázek 02: Polynukleotid
Polynukleotidy, DNA i RNA, se přirozeně vyskytují v živých organismech a používají se v biologických i biochemických experimentech. Polynukleotidy se používají v PCR a sekvenování DNA. Mohou být uměle syntetizovány pomocí oligonukleotidů. K syntéze a prodloužení polynukleotidového řetězce se přidávají nové nukleotidy a řetězec se prodlužuje přítomností polymerázových enzymů.
Jaké jsou podobnosti mezi oligonukleotidy a polynukleotidy?
- Oligonukleotidy a polynukleotidy jsou monomery DNA a RNA
- Oba se podílejí na mnoha genetických technikách včetně FISH a PCR.
Jaký je rozdíl mezi oligonukleotidy a polynukleotidy?
Oligonukleotid vs Polynukleotid |
|
| Oligonukleotid je fragment DNA nebo RNA, který se skládá z jednoho nebo více nukleotidových monomerů. | Polynukleotid je biopolymer, který se skládá ze 13 nebo více nukleotidových monomerů. |
| Velikost | |
| Oligonukleotid je kratší než polynukleotid. | Polynukleotid je delší než oligonukleotid. |
| Function | |
| Oligonukleotidy se používají v genetických technikách, jako je FISH. PCR, DNA micro array. | Polynukleotidy se používají při FISH, PCR, sekvenování DNA atd. |
Shrnutí – Oligonukleotidy vs Polynukleotidy
Nukleotidy jsou důležité biomolekuly, které se podílejí na hlavních metabolických funkcích v živých systémech. Jsou to monomery DNA i RNA. Nukleotidy jsou organické molekuly a skládají se ze tří základních podjednotek: dusíkaté báze, pentózového cukru a fosfátové skupiny. Oligonukleotidy a polynukleotidy jsou dva důležité typy nukleotidů. Obě molekuly se používají v různých genetických technikách, včetně FISH a PCR. Oligonukleotidy se skládají z jednoho nebo více nukleotidových monomerů, zatímco polynukleotidy se skládají z 13 nebo více nukleotidových monomerů. Oligonukleotidy jsou kratší než polynukleotidy. Toto je rozdíl mezi oligonukleotidy a polynukleotidy.
Stáhnout PDF verzi oligonukleotidů vs polynukleotidy
Můžete si stáhnout PDF verzi tohoto článku a použít ji pro offline účely podle citace. Stáhněte si PDF verzi zde Rozdíl mezi oligonukleotidem a polynukleotidem
