Klíčový rozdíl mezi fykocyaninem a alofykokyaninem je ten, že fykocyanin absorbuje a vyzařuje na kratších vlnových délkách než alofykocyanin.
Fykobiliproteiny jsou rodinou ve vodě rozpustných proteinů, které jsou přítomny v sinicích a některých druzích řas. Fykocyanin a alofykocyanin jsou dva hlavní členové této rodiny.
Co je fykocyanin?
Fykocyanin je pigment-proteinový komplex z rodiny světlosběrných fykobiliproteinů. Mezi další důležité členy této rodiny patří allofykocyanin a fykoerythrin. Tento pigment je doplňkovým pigmentem k chlorofylu. Obecně jsou všechny fykobiliproteiny ve vodě rozpustné komplexy, které nemohou existovat v membránách jako karotenoidy. Namísto toho, aby existovaly v membránách, mají tyto pigmenty tendenci se shlukovat a vytvářet shluky, které mohou přilnout k membránám známým jako fykobilisomy.
Obrázek 01: Extrahované fykocyaninové pigmenty (ze sinic)
Můžeme pozorovat, že fykocyanin má charakteristickou světle modrou barvu, která může absorbovat oranžové a červené světlo (blízko 620 nm) a může emitovat fluorescenci (kolem 650 nm). Tento barevný pigment můžeme najít u sinic a název „Phycocyanin“pochází z řeckého významu pro „Phyco“, což znamená „řasy“a přípona „cyanin“z řeckého významu pro „Kyanos“, což znamená „tmavě modrá“.
Molekuly fykocyaninu obvykle sdílejí společnou strukturu se všemi fykobiliproteiny. Když uvažujeme o struktuře tohoto pigmentu, začíná se sestavováním fykobiliproteinových monomerů. Tyto monomery jsou heterodimery sestávající z alfa a beta podjednotek s jejich příslušnými chromofory. Chromofory a podjednotky jsou spojeny chemickou thioetherovou vazbou.
Podjednotky struktury Phycocyaninu typicky obsahují osm alfa-helixů. Monomerní struktury mají tendenci se spontánně agregovat za vzniku prstencových trimerů, které mají rotační symetrii a centrální kanál. Kromě toho mají trimery tendenci agregovat se v párech za vzniku hexamerů, které jsou podporovány dalšími linkerovými proteiny. Proto každá tyčinka fykobilisomu obsahuje dva nebo více hexamerů fykocyaninu.
Co je Allofykocyanin?
Allofykocyanin je proteinová molekula, která pochází z rodiny fykobiliproteinů a je doplňkovým pigmentem chlorofylu. Mezi další členy této rodiny fykobiliproteinů sbírajících světlo patří fykocyanin, fykoerythrin a fykoerythrocyanin. Alofykokyaninové pigmenty mohou absorbovat a vyzařovat červené světlo a tento pigment snadno najdeme v sinicích a červených řasách.
Obrázek 02: Vzhled alofykocyaninu v diagramu
Alofykocyanin můžeme izolovat z různých druhů červených nebo modrozelených řas. Tyto řasy produkují mírně odlišné formy molekuly. Obecně platí, že molekula alofykokyaninu obsahuje dvě různé podjednotky nazývané alfa a beta podjednotka. Každá podjednotka má jeden fykokyanobilinový chromofor.
Alofykocyanin má různé aplikace; mnoho nástrojů bylo vyvinuto speciálně pro alofykokyanin. Tato složka se například běžně používá v imunotestech, včetně FACS, průtokové cytometrie atd.
Jaké jsou podobnosti mezi fykocyaninem a alofykocyaninem?
- Fykocyanin a allofykocyanin jsou ve vodě rozpustné proteiny
- Oba patří do rodiny fykobiliproteinů.
Jaký je rozdíl mezi fykocyaninem a alofykocyaninem?
Fykobiliproteiny jsou rodinou ve vodě rozpustných proteinů, které jsou přítomny v sinicích a některých druzích řas. Fykocyanin a alofykocyanin jsou dva hlavní členové této rodiny. Klíčový rozdíl mezi fykocyaninem a alofykokyaninem je v tom, že fykocyanin absorbuje a vyzařuje na kratších vlnových délkách než alofykocyanin.
Níže uvedená infografika uvádí další rozdíly mezi fykocyaninem a alofykocyaninem v tabulkové formě pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – fykocyanin vs alofykocyanin
Fykobiliproteiny jsou rodinou ve vodě rozpustných proteinů, které jsou přítomny v sinicích a některých druzích řas. Fykocyanin a alofykocyanin jsou dva hlavní členové této rodiny. Klíčový rozdíl mezi fykocyaninem a alofykokyaninem je ten, že fykocyanin absorbuje a vyzařuje na kratších vlnových délkách než alofykocyanin.
