Klíčový rozdíl mezi NAAT a PCR spočívá v tom, že NAAT je metoda, která amplifikuje genetický materiál několika způsoby, včetně polymerázové řetězové reakce, vytěsnění řetězce nebo amplifikace zprostředkované transkripcí, zatímco PCR je metoda, která amplifikuje genetický materiál pouze pomocí tepelné cyklování.
Patogeny se identifikují hlavně na základě amplifikace jejich genetického materiálu. Většina technik v této oblasti se zaměřuje na detekci genetického materiálu patogenu amplifikací specifických sekvencí v reálném čase. Proto jsou výsledky v diagnostickém kontextu produkovány velmi rychle. NAAT, PCR, biosenzor a LCR je několik technik používaných v laboratořích k amplifikaci genetického materiálu patogenu.
Co je NAAT?
Test amplifikace nukleových kyselin (NAAT) je metoda v molekulární biologii, která amplifikuje genetický materiál několika způsoby, jako je polymerázová řetězová reakce, amplifikace s posunem vlákna nebo amplifikace zprostředkovaná transkripcí. Amplifikace genetického materiálu může být také provedena pomocí technik, jako je ligační řetězová reakce a reakce rozvětvené DNA (quantiplex b DNA) v postupu NAAT. NAAT využívá specifičnost Watson-Crickova párování bází. V postupu NAAT se jednovláknová sonda nebo molekula primeru hybridizuje s cílovou molekulou DNA nebo RNA. Proto je design řetězce sondy vysoce významný pro zvýšení citlivosti a specificity detekce. Poté další krok NAAT amplifikuje genetický materiál vytvořením mnoha jeho kopií pro detekci.
Obrázek 01: NAAT
NAAT se v současnosti používá k detekci několika patogenů, jako je Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis a SARS-COV2. Navíc je test NAAT vyvinut pro zkrácení doby okna. Období okna je časové období mezi okamžikem, kdy byl pacient infikován, a okamžikem, kdy se ukázaly jako pozitivní testy na protilátky. Kromě toho byla screeningová metoda NAAT poprvé schválena v roce 1999 FDA. NAAT má mnoho výhod, včetně detekce nízkých hladin DNA nebo RNA, vysoké citlivosti a vysoké specificity.
Co je to PCR?
PCR je metoda v molekulární biologii, která zesiluje genetický materiál pouze pomocí tepelného cyklování. PCR je zkratka pro polymerázovou řetězovou reakci. Je to test k detekci genetického materiálu ze specifického organismu, jako jsou bakterie, houby a viry. Při diagnostice onemocnění detekuje PCR přítomnost patogenu, pokud má osoba patogen v době testu. Při diagnostice onemocnění má protokol PCR několik kroků, včetně odběru vzorku, extrakce DNA, PCR a sekvenování. Při testování patogenů se odebraný vzorek používá k extrakci genetického materiálu (DNA nebo RNA). Postup PCR vyžaduje speciální chemikálie, primery a enzymy, aby se vytvořily miliony kopií genetického materiálu uvnitř stroje PCR zvaného termální cykler. Po amplifikaci z produktu PCR lze patogen detekovat. Vědci používají k interpretaci výsledků speciální software.
Obrázek 02: PCR
V současné době se ve výzkumu používají různé typy PCR. Mezi nimi je několik RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD a Nested PCR. PCR je užitečná zejména při detekci faryngitidy (Streptokoková faryngitida), atypické pneumonie (Chlymydia pneumoniae), spalniček (Morbillivirus), hepatitidy (HBV) a ulcerózní urogenitální infekce (Haemophilus ducreyi).
Jaké jsou podobnosti mezi NAAT a PCR?
- NAAT a PCR jsou dvě důležité molekulárně biologické metody, které se používají k amplifikaci genetického materiálu.
- Nukleové kyseliny (DNA nebo RNA) jsou amplifikovány oběma technikami.
- Jsou to rychlé a rychlé techniky.
- Obě techniky se v současnosti používají pro diagnostiku onemocnění.
- Jsou dražší než konvenční metody.
Jaký je rozdíl mezi NAAT a PCR?
NAAT je metoda v molekulární biologii, která amplifikuje genetický materiál pomocí několika metod, zatímco PCR je metoda v molekulární biologii, která amplifikuje genetický materiál pouze pomocí tepelného cyklování. NAAT používá různé techniky amplifikace genetického materiálu, jako je polymerázová řetězová reakce, amplifikace s vytěsněním řetězce, amplifikace zprostředkovaná transkripcí, ligační řetězová reakce a reakce rozvětvené DNA (quantiplex b DNA). Na druhé straně PCR používá různé techniky amplifikace genetického materiálu, jako je RT-PCR. Multiplexní PCR, RAPD, Nested PCR. Toto je klíčový rozdíl mezi NAAT a PCR.
Níže uvedená infografika představuje rozdíly mezi NAAT a PCR v tabulkové formě pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – NAAT vs PCR
V laboratořích se k amplifikaci genetických materiálů používají různé molekulárně biologické nástroje. NAAT, PCR, biosenzor a LCR je několik takových technik. NAAT je molekulárně-biologická technika, která amplifikuje genetický materiál několika způsoby, jako je polymerázová řetězová reakce, vytěsnění vlákna nebo amplifikace zprostředkovaná transkripcí. PCR je metoda v molekulární biologii, která amplifikuje genetický materiál pomocí tepelného cyklování. Toto je klíčový rozdíl mezi NAAT a PCR.
