Klíčový rozdíl mezi snRNA a snoRNA je ten, že snRNA zahrnuje alternativní sestřih pre-mRNA, zatímco snoRNA zahrnuje modifikaci rRNA a tRNA, úpravu mRNA a otisk genomu.
Malé RNA jsou polymerní molekuly RNA, které se skládají z méně než 200 nukleotidů. Obvykle jsou nekódující. Existují mezi messengerovými RNA, aby nesly signály. Malé RNA pocházejí z dokonalé dvouvláknové RNA, která je produkována působením RNA-dependentní RNA polymerázy. Malé RNA hrají důležitou roli v buněčné diferenciaci, růstu a proliferaci, apoptóze, metabolismu, migraci a obraně. Proto jsou malé RNA důležitými a kritickými regulátory vývoje a fyziologie. Malá jaderná RNA a malá jaderná RNA jsou dvě třídy malých molekul RNA.
Co je snRNA?
Malá jaderná RNA nebo snRNA je třída malých molekul RNA, které se nacházejí v jádře eukaryotických buněk. Průměrná délka snRNA je přibližně 150 nukleotidů. RNA polymeráza II nebo RNA polymeráza III přepisují snRNA. Hlavní funkcí snRNA je zpracování pre-messenger RNA v jádře. Pomáhají také regulovat transkripční faktory nebo RNA polymerázu II a udržovat telomery.
Obrázek 01: Mechanismus působení malé RNA
Existují dvě třídy snRNA založené na společných sekvenčních rysech a souvisejících proteinových faktorech, jako je RNA vázající LSm protein. Tyto dvě třídy jsou snRNA třídy Sm a snRNA třídy Lsm. SnRNA třídy Sm se skládá z vysokého obsahu uridinu U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 a U12. RNA polymeráza II přepisuje snRNA třídy SM. Po transkripci pre-snRNA obvykle dostanou do jádra 5' čepičku 7-methylguanosinu. Poté jsou prostřednictvím jaderných pórů exportovány do cytoplazmy k dalšímu zpracování. SnRNA třídy Lsm má vysoký obsah uridinu U6 a U6atac. RNA polymeráza III přepisuje snRNA třídy Lsm a neopouští jádro. Nejběžnějšími složkami lidské snRNA jsou spliceosomální RNA U1, sestřihosomální RNA U2, sestřihosomální RNA U4, sestřihosomální RNA U5 a sestřihosomální RNA U6.
Co je snoRNA?
Malá nukleolární RNA nebo snoRNA je třída malých molekul RNA, které řídí chemické modifikace v jiné RNA, jako je ribozomální RNA, transferová RNA a malá jaderná RNA. Každá molekula snoRNA je během procesu modifikace spojena s přibližně čtyřmi jádrovými proteiny v komplexu RNA/protein. SnoRNA obsahuje antisense prvek, který má přibližně 10-20 nukleotidů. Tyto báze jsou komplementární k sekvenci obklopující nukleotidy, které cílí na modifikaci v molekule pre-RNA.
Obrázek 02: Malá nukleární RNA
Existují dvě třídy snoRNA. Jsou to C/D box snoRNA a H/ACA box snoRNA. C/D box snoRNA je asociován s methylací a H/ACA box snoRNA je asociován s pseudo-uridylací. Každá molekula snoRNA působí jako vodítko pro jednu nebo dvě modifikace v cílové RNA. C/D box snoRNA obsahuje dva krátké konzervované sekvenční motivy C a D, v blízkosti 5' a 3' konců snoRNA. Krátké oblasti sestávající z 5 nukleotidů se uspořádají upstream od C boxu a downstream od D boxu a tvoří strukturu stem-box. Tím se motivy C a D boxů přibližují. Struktura stem-boxu je důležitá pro správnou syntézu snoRNA a nukleolární lokalizaci. H/ACA box snoRNA má sekundární strukturu, která se skládá ze dvou vlásenek a dvou jednovláknových oblastí. Toto je běžně známé jako struktura vlásenka-závěs-vlásenka-ocas. H/ACA box snoRNA se také skládá ze dvou konzervovaných motivů H a ACA. Oba se nacházejí v jednovláknových oblastech. H box je v pantu a ACA je v ocasní oblasti. Tři nukleotidy tvoří 3' konec sekvence.
Jaké jsou podobnosti mezi snRNA a snoRNA?
- snRNA a snoRNA jsou malé RNA.
- Oba jsou přítomny v eukaryotických buňkách.
- Obě jsou nekódující molekuly RNA.
- Navíc se podílejí na úpravě RNA během procesu transkripce.
Jaký je rozdíl mezi snRNA a snoRNA?
snRNA se účastní alternativního sestřihu pre-mRNA, zatímco snoRNA modifikuje hlavně molekuly RNA. Toto je klíčový rozdíl mezi snRNA a snoRNA. Kromě toho jsou snRNA dlouhé asi 150 nukleotidů a často se vyskytují spojené se skupinou proteinů a komplexů nazývaných malé jaderné ribonukleoproteiny. snoRNA jsou dlouhé asi 60-170 nukleotidů a nacházejí se hlavně v jadérku.
Kromě toho jsou snRNA transkribovány buď RNA polymerázou II nebo RNA polymerázou III, zatímco snoRNA je transkribována pouze RNA polymerázou II.
Níže uvedená infografika představuje rozdíly mezi snRNA a snoRNA v tabulkové formě pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – snRNA vs snoRNA
snRNA a snoRNA jsou třídy malých molekul RNA. snRNA se účastní alternativního sestřihu pre-mRNA, zatímco snoRNA modifikuje hlavně molekuly RNA. Toto je klíčový rozdíl mezi snRNA a snoRNA. Malé RNA jsou polymerní molekuly RNA, které se skládají z méně než 200 nukleotidů na délku a jsou obvykle nekódující. snRNA se nacházejí v jádře eukaryot. snoRNA se nacházejí v archaea a eukaryotech. Transkripce snRNA probíhá prostřednictvím RNA polymerázy II a II, zatímco pouze RNA polymeráza II se účastní transkripce snoRNA. Toto shrnuje rozdíl mezi snRNA a snoRNA.
