Klíčový rozdíl mezi N vázanými a O vázanými oligosacharidy je v tom, že N vázané oligosacharidy se tvoří, když se N atomů proteinů váže s cukrem, zatímco O vázané oligosacharidy se tvoří, když se 0 atomy serinu nebo threoninu vážou s cukr.
Oligosacharidy jsou molekuly sacharidů, které obsahují tři až šest jednotek monosacharidů nebo jednoduchých cukrů. N-vázané oligosacharidy jsou sacharidové molekuly, kde je oligosacharid připojen k atomu dusíku. O-vázané oligosacharidy jsou na druhé straně typem sacharidů, kde je molekula cukru připojena k atomu kyslíku serinového nebo threoninového zbytku v proteinu.
Co jsou N-vázané oligosacharidy?
N-vázané oligosacharidy jsou molekuly sacharidů, jejichž oligosacharidy jsou připojeny k atomům dusíku. K tomu dochází prostřednictvím procesu N-glykosylace. Oligosacharidy jsou sacharidové sloučeniny obsahující několik molekul cukru. Někdy se jim říká „glykany“. V procesu N-vázané glykosylace atom dusíku obvykle pochází z amidového dusíku asparaginového zbytku proteinu. Tento proces je nejlépe popsán v oblasti biochemie.
V mnoha eukaryotických proteinech obvykle probíhá N-vázaná glykosylace. Mezi eukaryoty se toto vyskytuje široce u archaea, ale zřídka u bakterií. Můžeme určit povahu N-vázaného oligosacharidu, který je připojen ke glykoproteinu prostřednictvím proteinu a buňky, ve které je exprimován. Typ N-vázaného oligosacharidu také závisí na druhu organismů.
V glykoproteinu jsou obvykle dva typy vazeb: vazba mezi sacharidovými zbytky v glykanu a vazba mezi glykanovým řetězcem a molekulou proteinu. Tam jsou cukerné části vzájemně spojeny prostřednictvím glykosidických vazeb. Glykosidické vazby jsou typicky C1-C4 vazby. Kromě toho vazba mezi oligosacharidem a proteinovým zbytkem vyžaduje rozpoznání konsensuální sekvence.
Co jsou O-vázané oligosacharidy?
O-navázané oligosacharidy jsou typem sacharidů, kde je molekula cukru připojena k atomu kyslíku serinového nebo threoninového zbytku v proteinu. Proces tvorby této vazby je známý jako O-vázaná glykosylace. Je to proces post-tranziční modifikace, který se odehrává po syntéze proteinu.
Při zvažování eukaryot k této syntéze dochází v endoplazmatickém retikulu, Golgiho aparátu a někdy i v cytoplazmě. U prokaryot k tomu dochází v cytoplazmě. Existuje několik různých typů cukrů, které se mohou vázat se serinem nebo threoninem. Tato vazba může ovlivnit protein různými způsoby. Např. obchodování s buňkami v imunitním systému, což umožňuje rozpoznání cizího materiálu.
Jaký je rozdíl mezi N-vázanými a O-vázanými oligosacharidy?
N-vázané oligosacharidy jsou molekuly sacharidů, kde je oligosacharid připojen k atomu dusíku, zatímco O-vázané oligosacharidy jsou typem sacharidů, kde je molekula cukru připojena k atomu kyslíku serinového nebo threoninového zbytku v protein. Klíčový rozdíl mezi N-vázanými a O-vázanými oligosacharidy je tedy ten, že N-vázané oligosacharidy se tvoří, když se atom N proteinů váže s cukrem, zatímco O-vázané oligosacharidy se tvoří, když se 0 atomy serinu nebo threoninu vážou s cukrem.
Níže uvedená infografika představuje rozdíly mezi N-navázanými a O-navázanými oligosacharidy v tabulkové formě pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – N-vázané vs. O-vázané oligosacharidy
Oligosacharidy jsou typem molekuly cukru. Klíčový rozdíl mezi N-vázanými a O-vázanými oligosacharidy je ten, že N-vázané oligosacharidy se tvoří, když se N atomů proteinů váže s cukrem, zatímco O-vázané oligosacharidy se tvoří, když se 0 atomů serinu nebo threoninu váže s cukrem.
