Klíčový rozdíl mezi guanidinthiokyanátem a guanidinhydrochloridem je ten, že guanidinthiokyanát je silnější proteinový denaturant, který se častěji používá při izolaci RNA, zatímco guanidinhydrochlorid je slabší proteinový denaturant, který se při izolaci RNA používá méně.
Denaturace je proces, při kterém proteiny ztrácejí svou kvartérní strukturu, terciární strukturu a sekundární strukturu, která je normálně přítomna v jejich přirozeném stavu. Lze to provést aplikací některých externích stresů nebo sloučenin, jako je silná kyselina nebo zásada, koncentrovaná anorganická sůl, organické rozpouštědlo (alkohol, chloroform), míchání, záření nebo teplo. Guanidin thiokyanát a guanidin hydrochlorid jsou dva různé typy proteinových denaturantů.
Co je guanidinthiokyanát?
Guanidinthiokyanát (GTC) je silnější činidlo denaturující proteiny, které se běžněji používá při izolaci RNA. Je také známý jako guanidinium isothiokyanát (GITC). Protože jde o chaotropní činidlo, jde o chemickou sloučeninu běžně používanou jako obecný denaturační činidlo pro proteiny. Chaotropní činidlo je molekula ve vodném roztoku, která může narušit síť vodíkových vazeb mezi molekulami vody. To má vliv na stabilitu nativního stavu jiných molekul v roztoku, jako jsou makromolekuly, jako jsou proteiny a nukleové kyseliny, oslabením hydrofobního účinku. Chaotropní činidla, jako je guanidinthiokyanát, snižují množství řádu ve struktuře proteinu tvořeného molekulami vody jak ve velkém, tak v hydratačních obalech kolem hydrofobních aminokyselin. To může způsobit denaturaci bílkovin.
Guanidinthiokyanát lze použít k deaktivaci virů, jako je chřipka, které způsobují onemocnění jako španělská chřipka v roce 1918. Proto může být použit v lékařských nebo nemocničních zařízeních. Kromě toho se guanidinthiokyanát používá také k lýze buněk a virových částic při extrakcích RNA a DNA. Funkcí guanidinthiokyanátu je zde napomáhat lyži a bránit aktivitě enzymů RNázy a enzymů DNázy denaturací. Tyto enzymy by jinak poškodily extrakt (RNA nebo DNA).
Co je guanidin hydrochlorid?
Guanidin hydrochlorid (GdnHCl) je slabší proteinový denaturant, který se méně běžně používá při izolaci RNA. Je také známý jako guanidiniumchlorid (GdmCl). Je to hydrochloridová sůl guanidinu. Guanidin hydrochlorid je chaotropní a jeden z denaturačních činidel používaných ve fyzikálně-chemických studiích skládání proteinů.
Obrázek 01: Guanidin hydrochlorid
Guanidin hydrochlorid má také schopnost snižovat aktivitu enzymů a zvyšovat rozpustnost hydrofobních molekul. Normálně při vyšších koncentracích guanidin hydrochloridu ztrácejí proteiny svou uspořádanou strukturu. Proteiny mají tendenci se náhodně svinout při této koncentraci guanidin hydrochloridu. V lékařských nebo nemocničních zařízeních je guanidin hydrochlorid indikován ke zmírnění příznaků svalové slabosti a snadné únavnosti spojených s Eaton-Lambertovým syndromem. Kromě toho mohou vedlejší účinky užívání guanidin hydrochloridu zahrnovat perist altiku, průjem a fatální útlum kostní dřeně.
Jaké jsou podobnosti mezi guanidinthiokyanátem a guanidinhydrochloridem?
- Guanidinthiokyanát a guanidinhydrochlorid jsou dva různé typy proteinových denaturantů.
- Oba denaturanty mají ve své struktuře guanidin.
- Jsou to chaotropní agenti.
- Pro izolaci RNA lze použít oba denaturanty.
- Oba se používají v lékařských nebo nemocničních zařízeních.
Jaký je rozdíl mezi guanidinthiokyanátem a guanidinhydrochloridem?
Guanidinthiokyanát je silnější proteinový denaturační prostředek, který se běžněji používá při izolaci RNA, zatímco guanidin hydrochlorid je slabší proteinový denaturant, který se při izolaci RNA používá méně. Toto je klíčový rozdíl mezi guanidinthiokyanátem a guanidin hydrochloridem. Kromě toho je chemický vzorec guanidinthiokyanátu C2H6N4S, zatímco chemický vzorec guanidin hydrochloridu je CH5N3HCl.
Níže uvedená infografika představuje rozdíly mezi guanidinthiokyanátem a guanidinhydrochloridem v tabulkové formě pro srovnání vedle sebe.
Shrnutí – guanidinthiokyanát vs guanidin hydrochlorid
Guanidinthiokyanát a guanidinhydrochlorid jsou dva různé typy proteinových denaturantů. Oba denaturanty jsou chaotropy. Guanidin thiokyanát je silnější protein denaturační činidlo, které se běžněji používá při izolaci RNA, zatímco guanidin hydrochlorid je slabší proteinový denaturant, který se při izolaci RNA používá méně. Toto shrnuje rozdíl mezi guanidinthiokyanátem a guanidin hydrochloridem.
