Klíčový rozdíl mezi kandidátním genem a GWAS spočívá v tom, že přístup kandidátního genu zkoumá genetickou variaci v rámci malého počtu předem specifikovaných genů zájmu, zatímco GWAS zkoumá celý genom na společnou genetickou variaci za konkrétním chorobným stavem.
Kandidátní genový přístup a celogenomové asociační studie (GWAS) jsou dvě metody, které jsou důležité pro detekci genetické náchylnosti k nemocem. Přístup kandidátských genů je založen na předem specifikovaném malém počtu genů, zatímco GWAS je založen na testování celého genomu. Přístup kandidátských genů tedy vyžaduje předchozí znalost genů s významem pro onemocnění, na rozdíl od GWAS.
Co je kandidátský gen?
Přístup kandidátských genů je jednou z technik, která zkoumá souvislost mezi genetickými variacemi v rámci předem specifikovaných zájmových genů a fenotypy nebo chorobnými stavy. V tomto přístupu je nutné mít předchozí znalosti o biologickém funkčním dopadu genu na danou vlastnost nebo onemocnění. Na základě těchto znalostí je vybrán malý počet genů a analyzovány na genetické variace.
Obrázek 01: Přístup kandidátských genů
Výběr genů se provádí na základě biologické, fyziologické a funkční relevance pro danou chorobu v tomto přístupu. Tento přístup je často navržen jako případová-kontrolní studie.
Co je GWAS?
GWAS je zkratka pro Genome-Wide Association Study. Odkazuje také na celogenomové asociační studie. Tyto studie se zaměřují především na observační studie. Analyzují genetické varianty různých jedinců obvykle spojené s určitým rysem. Pro analýzu GWAS je důležitý celý genom.
GWAS je důležitým nástrojem při analýze jednonukleotidových polymorfismů spojených s různými chorobnými stavy. Je to srovnávací studie různých jednonukleotidových polymorfismů v široké populaci. Studijní vzorek GWAS je velmi vysoký; proto má také formát průřezové kohortové studie.
Obrázek 02: GWAS
První studie GWAS se uskutečnila s ohledem na infarkt myokardu a analyzovala geny spojené s infarktem myokardu. V současnosti hraje GWAS důležitou roli při určování genetického pozadí komplexních onemocnění s neznámou etiologií.
Jaké jsou podobnosti mezi kandidátským genem a GWAS?
- Přístup kandidátských genů i GWAS jsou techniky, které analyzují genetickou asociaci mezi genotypem a fenotypem onemocnění.
- Oba přístupy pomáhají pochopit genetický základ náchylnosti k nemocem.
Jaký je rozdíl mezi kandidátským genem a GWAS?
Přístup kandidátských genů je založen na kandidátských genech nebo předem specifikovaných genech, zatímco GWAS je založen na celém genomu. Toto je klíčový rozdíl mezi kandidátním genem a GWAS. Také v přístupu kandidátských genů je výběr genů nezbytný, zatímco v GWAS to není potřeba.
Přístup kandidátských genů navíc vyžaduje předchozí znalosti o genech relevantních pro onemocnění, zatímco u GWAS to není nutné.
Níže uvedená infografika poskytuje podrobnější srovnání související s rozdílem mezi kandidátním genem a GWAS.
Shrnutí – Kandidátský gen vs GWAS
Kandidátský gen a GWAS jsou dvě studie asociace genů. Přístup kandidátských genů se zaměřuje na genetické variace spojené s onemocněním v rámci malého počtu předem specifikovaných genů. Naproti tomu GWAS zkoumá genetické variace spojené s onemocněním v rámci celého genomu. Toto je klíčový rozdíl mezi kandidátním genem a GWAS. Obě metody jsou důležité pro pochopení genetického základu náchylnosti k nemocem.
